当前解析结果
SmilChr02G002443| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002443 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002443 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002443 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 42680276 - 42682380 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131013541 |
|---|---|
| GeneID | 131013541 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131013541 |
| 原始查询 | LOC131013541 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131013541 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057797642.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057797642.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057797642.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057797642.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057797642.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:42680422 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B115,B139,B73,D6 |
Chr2:42680424 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B94,C66 |
Chr2:42680443 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B139,B73 |
Chr2:42680454 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B70,B95 |
Chr2:42680464 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A13,B105,B11,C75 |
Chr2:42680472 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B118,B27 |
Chr2:42680510 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B32,C48 |
Chr2:42680514 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B123,C28 |
Chr2:42680519 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B119 |
Chr2:42680531 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C79 |
Chr2:42680543 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C31 |
Chr2:42680545 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B126,B53,B71 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。