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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002461`

染色体: Chr02 坐标: 42920232-42921125 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002461`
名称	SmilChr02G002461
描述	protein S40-3-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	42920232 - 42921125 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013558`
GeneID	`131013558`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013558`
原始查询	`LOC131013558`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein S40-3-like
产物	protein S40-3-like
Arabidopsis	`AT2G34340` (AT2G34340) senescence regulator (Protein of unknown function, DUF584) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817996] identity=37.3; qcov=1.16; evalue=6.54e-19; confidence=low
Rice	`Os11g0154300` (OsS40-12) - identity=52.6; qcov=0.672; evalue=2.64e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04520 (Senescence_reg)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013558

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797664.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057797664.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797664.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797664.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797664.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:42920523`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	15	A10,A4,B108,B11,B131,B136,B24,B34,B65,B69,B86,C15,C46,C55,C7
`Chr2:42920561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,B70,C57,C58
`Chr2:42920615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:42920631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B26,B61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797664.1

116 aa

116

Senescence_reg

PF04520 Senescence_reg 27-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797664.1`	Pfam	`PF04520`	Senescence_reg	Family	27	115	4e-18	67.5	Senescence regulator

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941681.1
ATAAACAAGTCTGTCTGAGCCCCAAAAAAATGAACTTTTGGAAAGCGGGGACCGCACTCAACGCCTCTCGTAGTGACGCCAGCAATCGAAGTGTGCTTACTACGACATTCATTTCCCCATCATATCAATCAATCATTCATTTCCTCTTATAAATTCCTCCATTTCTCATTCCTCAACTCTTCATCTCCTTCCCCAATCCCTCAACCATTAAAACAAACCCCTAATTCTCCGATTCCAATGGCGGAGGAAGAGTTCCAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013558
ATGGCGGAGGAAGAGTTCCAAGAGTCCGACGTCGTGTTCCGAGACACCGACAGCGACGAGACAGCCGCGGCTCGCGAGGCGCCGGCGAGCTGCCGGAGATCGAAATCGAGATTGAGGTCGGTTCCGGTGAACATTCCGGCGAGCGCGCCGCGGAACGCGTGGCGCCGCTGCGCGGACGACGGCAGCGGCGGCGAGGACGGGGAAATGGTGCCACCGCACGTGATCGTAGGGCGGCGCGTGGCCGGGAAGATGATGGCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797664.1
MAEEEFQESDVVFRDTDSDETAAAREAPASCRRSKSRLRSVPVNIPASAPRNAWRRCADDGSGGEDGEMVPPHVIVGRRVAGKMMALSICGRILRKGRDLSEFRNLILRMTGFLET

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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