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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002481`

染色体: Chr02 坐标: 43206800-43209621 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002481`
名称	SmilChr02G002481
描述	pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase 2, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	43206800 - 43209621 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013576`
GeneID	`131013576`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013576`
原始查询	`LOC131013576`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase 2, mitochondrial
产物	pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase 2%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT1G29810` (AT1G29810) Transcriptional coactivator/pterin dehydratase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839859] identity=67.4; qcov=0.697; evalue=1.16e-65; confidence=high
Rice	`Os01g0663500` - identity=69.1; qcov=0.665; evalue=3.62e-57; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006729 (tetrahydrobiopterin biosynthetic process); GO:0008124 (4-alpha-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase activity)
KEGG	smil00790 (Folate biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01329 (Pterin_4a)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013576

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057797682.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057797682.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797682.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797682.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797682.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:43208117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr2:43209361`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B25
`Chr2:43209361`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B25
`Chr2:43209362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,C27,C44,D3
`Chr2:43209370`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B25
`Chr2:43209370`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B25
`Chr2:43209377`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B25
`Chr2:43209377`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B25
`Chr2:43209386`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B25
`Chr2:43209386`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B25
`Chr2:43209387`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B25
`Chr2:43209387`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797682.1

185 aa

185

Pterin_4a

PF01329 Pterin_4a 80-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797682.1`	Pfam	`PF01329`	Pterin_4a	Domain	80	171	1e-27	96.8	Pterin 4 alpha carbinolamine dehydratase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941699.1
CCCTTACAAACCGTTTTCATATGCACCCATACAATACAACATGTCATTCAGCGCGACCTCCAAATGGCACTTCATTCTCGTCTCTGCGCTCTCTCCTTCAACGCCCGTGTTGTACTGACGCCGCTCTTGCAGGGAGTCTGGACTGTCAATGGACGCTCGAGTATTCGTGTTGCTGATAGATCTCAAGGCCATGAAGGATGCTTGTGGAATAATAGCATTAATGGAATTAGGGCTTTTTGTATTAACCAAGATTTGGCTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013576
ATGGCACTTCATTCTCGTCTCTGCGCTCTCTCCTTCAACGCCCGTGTTGTACTGACGCCGCTCTTGCAGGGAGTCTGGACTGTCAATGGACGCTCGAGTATTCGTGTTGCTGATAGATCTCAAGGCCATGAAGGATGCTTGTGGAATAATAGCATTAATGGAATTAGGGCTTTTTGTATTAACCAAGATTTGGCTAGTAAGAAGTGTGTGCCATGCAGCTCCAAAGATCTGAGGGCTATGACTGAGGAGACAGCCAACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797682.1
MALHSRLCALSFNARVVLTPLLQGVWTVNGRSSIRVADRSQGHEGCLWNNSINGIRAFCINQDLASKKCVPCSSKDLRAMTEETANILIERVPGWNLVKENDSWKLHRSWKVKTFVKGMEFLRLVADVAEAEGHHPDLHLVGWNNVKIDIWTHAVGGLTENDFILAAKINGLNLHNLLRITPTNK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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