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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000401`

染色体: Chr01 坐标: 8212428-8213027 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000401`
名称	SmilChr01G000401
描述	uncharacterized SmilChr01G000401
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	8212428 - 8213027 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013586`
GeneID	`131013586`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013586`
原始查询	`LOC131013586`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC); PF08284 (RVP_2); PF13650 (Asp_protease_2); PF13975 (gag-asp_proteas)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013586

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797728.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057797728.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057797728.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057797728.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057797728.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:8212429`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B122,B46,C37
`Chr1:8212429`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B122,B46,C37
`Chr1:8212434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	67	A19,A24,A4,A5,B1,B105,B109,B112,B113,B115,B120,B122,B13,B131,B135,B137,B139,B14,B15,B2,B21,B38,B39,B4,B46,B48,B49,B5,B50,B52,B55,B59,B61,B67,B71,B72,B86,B87,B89,B9,B90,C18,C2,C22,C24,C29,C30,C32,C36,C4,C40,C46,C5,C55,C66,C68,C73,C74,C79,C85,C87,C9,D1,D2,D4,D5,D9
`Chr1:8212463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr1:8212465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B140,D7
`Chr1:8212479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	36	A11,A4,A9,B12,B120,B128,B130,B15,B30,B41,B49,B51,B52,B53,B57,B70,B75,B78,B83,B90,B92,C12,C15,C16,C28,C55,C61,C62,C64,C69,C7,C71,C77,C8,C83,D10
`Chr1:8212492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B33,B44
`Chr1:8212497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B101,B40,B80
`Chr1:8212497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B40,B80
`Chr1:8212517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B114,C51,C60,C74
`Chr1:8212518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B139,B44
`Chr1:8212524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A1,B108,B21,B26,B29,B31,B47,B65,B7,B79,B9,C19,C4,C43,C45,C50,C56,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797728.1

199 aa

100

199

zf-CCHC

RVP_2

Asp_protease_2

gag-asp_proteas

PF00098 zf-CCHC 5-21 aa PF08284 RVP_2 77-199 aa PF13650 Asp_protease_2 100-186 aa PF13975 gag-asp_proteas 100-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797728.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	5	21	3.8e-06	27.5	Zinc knuckle
`XP_057797728.1`	Pfam	`PF08284`	RVP_2	Domain	77	199	8.1e-25	87.9	Retroviral aspartyl protease
`XP_057797728.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	100	186	2e-06	29.2	Aspartyl protease
`XP_057797728.1`	Pfam	`PF13975`	gag-asp_proteas	Domain	100	188	2.4e-07	31.9	gag-polyprotein putative aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941745.1
ATGGGACAGAACAGCTGCTATACCTGCGGAAGGATCGGACACTACTCCAATCAGTGTCCAAATCGCCAGCAAAGTGGAGGCGGAGGAAGGCCAAACCAGTACCAGCCACAGCTCAAAGCGATGGAAGGAGTCCTACCGCTACCGCCGCCACAGCGACAGCAGCCAGCCTATCGACCACGTCAGTCAGGAAGGCAGCCGCCAGCCCCGCAGGTGAATCAACCCCATCATCAGAGAGTGTTTGCGCTTGAGCAGAAGGCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013586
ATGGGACAGAACAGCTGCTATACCTGCGGAAGGATCGGACACTACTCCAATCAGTGTCCAAATCGCCAGCAAAGTGGAGGCGGAGGAAGGCCAAACCAGTACCAGCCACAGCTCAAAGCGATGGAAGGAGTCCTACCGCTACCGCCGCCACAGCGACAGCAGCCAGCCTATCGACCACGTCAGTCAGGAAGGCAGCCGCCAGCCCCGCAGGTGAATCAACCCCATCATCAGAGAGTGTTTGCGCTTGAGCAGAAGGCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797728.1
MGQNSCYTCGRIGHYSNQCPNRQQSGGGGRPNQYQPQLKAMEGVLPLPPPQRQQPAYRPRQSGRQPPAPQVNQPHHQRVFALEQKAQDKNRGNLAGIDELKGVPIVILFDMGASHSFISHTCVDTMELNIEPAPQHLRVMTPIGRTTTVSLICPDSEFELESIKLRARNLRMMSMWYINIILGMDWLEENHVPIQCKER

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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