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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002519`

染色体: Chr02 坐标: 43728294-43734495 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002519`
名称	SmilChr02G002519
描述	protein DUF642 L-GALACTONO-1,4-LACTONE-RESPONSIVE GENE 2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	43728294 - 43734495 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013610`
GeneID	`131013610`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013610`
原始查询	`LOC131013610`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DUF642 L-GALACTONO-1,4-LACTONE-RESPONSIVE GENE 2
产物	protein DUF642 L-GALACTONO-1%2C4-LACTONE-RESPONSIVE GENE 2
Arabidopsis	`AT1G29980` (AT1G29980) choice-of-anchor C domain protein, putative (Protein of unknown function, DUF642) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839877] identity=70.8; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0756600` - identity=69.8; qcov=0.964; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF04862 (DUF642)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013610

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057797725.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057797725.1`
3	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057797725.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797725.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797725.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:43728482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B140,B63,B81,B83
`Chr2:43728738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:43728818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,B82
`Chr2:43728841`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	47	A15,A23,A24,A9,B1,B100,B104,B112,B137,B2,B35,B45,B47,B54,B55,B56,B65,B68,B72,B76,B93,B95,B96,C14,C18,C19,C2,C28,C3,C31,C34,C36,C4,C45,C49,C56,C62,C65,C71,C78,C82,C85,C86,D10,D11,D3,D8
`Chr2:43728843`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	47	A15,A23,A24,A9,B1,B100,B104,B112,B137,B2,B35,B45,B47,B54,B55,B56,B65,B68,B72,B76,B93,B95,B96,C14,C18,C19,C2,C28,C3,C31,C34,C36,C4,C45,C49,C56,C62,C65,C71,C78,C82,C85,C86,D10,D11,D3,D8
`Chr2:43728931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr2:43728938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:43728945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B5
`Chr2:43728957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr2:43728981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr2:43729641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B140,B63,B81,B83
`Chr2:43729657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B52,B82,C5,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797725.1

388 aa

194

388

DUF642

PF04862 DUF642 30-186 aa PF04862 DUF642 199-364 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797725.1`	Pfam	`PF04862`	DUF642	Domain	30	186	2.4e-86	288.1	Protein of unknown function (DUF642)
`XP_057797725.1`	Pfam	`PF04862`	DUF642	Domain	199	364	2.4e-86	288.1	Protein of unknown function (DUF642)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941742.1
AACAGCTCGAATCTCGGATAAAAAGACAATTGCTCTGTCTATTCCATTCCCTGCATCTCTCCCTTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCCCACTGTATACAAACTGTACTCCCTCTGCTTACACACACACACACACACTGACTGAGACATTGAGACTTATTAGAGAGAGAAAGGAAAAGGATCATTCGGCATTAAAGATGGTTCCGAGCTCAACATTATGCTTCCGCCTCTCTTTACTTGCATTACTGTTTGCTTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013610
ATGGTTCCGAGCTCAACATTATGCTTCCGCCTCTCTTTACTTGCATTACTGTTTGCTTTATCAGCTGCTGCTGTAGTTGAAGACGGGGAACTAGTGAATGGTGACTTCGAGACCCCGCCAACCGGCGGGTTCTCGCCGGAGGCAGGGATCTCAGACGGCCCCGGGTCGATCCCTGGGTGGAAGACGAACGGGACGGTGGAGGTGGTGGAGTCGGGGCAGAAGCAGGGTGGTATGATCCTGATCGTGCCGCAGGGGGCCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797725.1
MVPSSTLCFRLSLLALLFALSAAAVVEDGELVNGDFETPPTGGFSPEAGISDGPGSIPGWKTNGTVEVVESGQKQGGMILIVPQGAHAVRLGNDAEISQEVAVEKGALYSVTFSAARTCAQLEALNVSVPPASQTIDLQTLYSVQGWDTYAWAFQAAEAEARVVFRNPGMEDDPTCGPIIDDIAIKKLFVPDRPKDNAVVNGDFEEGPWMFRNESLGVLLPTNLDEETSSLPGWMVESNRAVRYVDSNHFSVPGGKRAVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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