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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002521`

染色体: Chr02 坐标: 43807370-43814211 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002521`
名称	SmilChr02G002521
描述	potassium channel KAT3-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	43807370 - 43814211 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013612`
GeneID	`131013612`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013612`
原始查询	`LOC131013612`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	potassium channel KAT3-like
产物	potassium channel KAT3-like
Arabidopsis	`AT5G46240` (KAT1) 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834666] identity=54.2; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0245800` (KAT3) - identity=59.9; qcov=0.744; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005249 (voltage-gated potassium channel activity); GO:0006813 (potassium ion transport); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00027 (cNMP_binding); PF00520 (Ion_trans); PF07885 (Ion_trans_2); PF11834 (KHA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013612

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797729.1`
2	Dendrite	Dendrite	0.20000	`XP_057797729.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797729.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797729.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797729.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:43808315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr2:43808408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr2:43808418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr2:43808467`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	A6,B123,B129,B138,B43,B59,B8,B82,B96,C21,C70,C79,D9
`Chr2:43808482`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A21,B58,B90
`Chr2:43808482`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A21,B58,B90
`Chr2:43808486`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A21,B58,B90
`Chr2:43808486`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A21,B58,B90
`Chr2:43808488`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A21,B58,B90
`Chr2:43808488`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A21,B58,B90
`Chr2:43808759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B127
`Chr2:43808789`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797729.1

657 aa

328

657

Ion_trans

Ion_trans_2

cNMP_binding

KHA

PF00520 Ion_trans 53-292 aa PF07885 Ion_trans_2 227-293 aa PF00027 cNMP_binding 390-476 aa PF11834 KHA 583-652 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797729.1`	Pfam	`PF00520`	Ion_trans	Family	53	292	4.9e-39	134.7	Ion transport protein
`XP_057797729.1`	Pfam	`PF07885`	Ion_trans_2	Family	227	293	5e-12	46.3	Ion channel
`XP_057797729.1`	Pfam	`PF00027`	cNMP_binding	Domain	390	476	1.7e-12	47.9	Cyclic nucleotide-binding domain
`XP_057797729.1`	Pfam	`PF11834`	KHA	Family	583	652	1.6e-23	83.2	KHA, dimerisation domain of potassium ion channel

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941746.1
CTGCCCTCGAGAGAGGCAACTTCCCATAAATGGAAAGTGCGAACAACCTCAAATTTAATTTGATTTTCCATAAATACAACACAAAATTTAACATTAGCAATTCCAAACATAAGTGATCATCACTAGCTAATTACCATTTACCCCTCCCGGCCCGTTCCTTTCCCATCCAACTCGATACATCCGCCACTCCACCTTCCCTGCCTGCCGGGGGAGACGCAAACTTTCCATAAATGGGAAGTGTGGGGGGGGAGTATATACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013612
ATGTCTCTTTCTTGTCTGAAAAACACGCTAAGTAAAAAGCTCTGCAATCACCATTTTCACATCAGCAATGGCCTACTCTCCACAGACCTTCTTCCATCGCTAGAAACCCGAACCAGGAAGCCCCGACGCCACATAATCTCCCCTTACGATCCATGCTATAGGATATGGGAGACGTTTCTAGTCCTCCTGGTGGTGTATTCGGCGTGGATTTCGCCTTTCCAGTTCGCATTCCTGAGCTACAAGCAAGACACTCTCTTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797729.1
MSLSCLKNTLSKKLCNHHFHISNGLLSTDLLPSLETRTRKPRRHIISPYDPCYRIWETFLVLLVVYSAWISPFQFAFLSYKQDTLFIVDNIINSFFAVDILLTFFLAYLDTHSYVVVDDPKRIAVRYLTSWFIFDVCSTVPFQFVAICFTYKSGGLGFNLLAMLRLWRLRRVSCLFARLEKDIRFNYFWTRCTKLVAVTLFAVHCAGCVNYMIADRYWDPRRTWIGAVYPNFKEMGIWDKYVAALYWSIVTLTTTGYGDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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