当前解析结果
SmilChr02G002549| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002549 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002549 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002549 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 44366303 - 44368574 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131013641 |
|---|---|
| GeneID | 131013641 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131013641 |
| 原始查询 | LOC131013641 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131013641 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057797754.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057797754.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057797754.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057797754.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057797754.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:44366447 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A20,B137,B58,C28,C49 |
Chr2:44366492 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C52 |
Chr2:44366505 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr2:44366522 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B1,B44,C52 |
Chr2:44366555 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B114,B140,B19,C1 |
Chr2:44366564 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B119,B45 |
Chr2:44366597 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B9 |
Chr2:44366598 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B47,B78,B9,C61 |
Chr2:44366611 |
A |
ACT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C8 |
Chr2:44366611 |
A |
ACT |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | C8 |
Chr2:44366617 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 49 | A14,A4,A9,B109,B114,B119,B121,B130,B132,B14,B140,B19,B20,B24,B25,B3,B33,B42,B47,B51,B55,B6,B64,B67,B69,B78,B88,C1,C12,C13,C17,C20,C22,C23,C31,C35,C41,C42,C52,C59,C61,C8,C80,C82,C87,D1,D4,D5,D9 |
Chr2:44366629 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C1,C86 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。