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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002551`

染色体: Chr02 坐标: 44396433-44400493 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002551`
名称	SmilChr02G002551
描述	BTB/POZ domain-containing protein At1g30440-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	44396433 - 44400493 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013644`
GeneID	`131013644`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013644`
原始查询	`LOC131013644`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BTB/POZ domain-containing protein At1g30440-like
产物	BTB/POZ domain-containing protein At1g30440-like
Arabidopsis	`AT1G30440` (AT1G30440) Phototropic-responsive NPH3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839923] identity=66.7; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0130600` (P0582D05.131) - identity=64.5; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00651 (BTB); PF03000 (NPH3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013644

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057797756.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057797756.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057797756.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057797756.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797756.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:44398170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,C41,D11
`Chr2:44398465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B5
`Chr2:44398482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B52,B82,C5,C55
`Chr2:44398495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:44398552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,B70,C57,C58
`Chr2:44398583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:44399041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B52,B82,C5,C55
`Chr2:44399043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B13,B2
`Chr2:44399089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr2:44399187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:44399236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B108,C12,C23,C57
`Chr2:44399261`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B112,C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797756.1

620 aa

310

620

BTB

NPH3

PF00651 BTB 25-113 aa PF03000 NPH3 214-472 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797756.1`	Pfam	`PF00651`	BTB	Domain	25	113	6e-09	36.8	BTB/POZ domain
`XP_057797756.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	214	472	6.2e-94	315.2	NPH3 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941773.1
GAATTTTGCATTCCTTGCATCATTCGACGTCAATTCTATATAAATGTAGTTATTAGCATGTCTTTGACCCAAATTAATGATTAGTAGTAAAACATTTAACCCATTTTCTCTTGTTTTTATATCATAAATCAATAAAGTTTCAATACACTTTCCCAGTTTGCTTAGTATGTGACCCCAAGTGTGGAAGTTAAACGTCGACGAAAAAAGCAATCGGTCACACGGCAATACTAAAAAACGAATAAAAAATGAAATCTTGATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013644
ATGGCTTGTGTGAAGTTGGGATCCAAGACTGAGGCATTCCAGAGGCAAGGACAGGCTTGGTTTTGCACGAGTGGTCTTCCAAGTGATGTGGTTGTCGAAGTTGGGGAAATGTCGTTCCATCTTCACAAGTTTCCATTGCTTTCAAGAAGTGGGGTTATGGAACGGCTCGTTGAAGAGGCGTCCAAAGGAGAGGAAGGCTGTGTCATTAAGCTACCCGACATTCCCGGTGGAGCGAAGACATTTGAAACAGTAGCTAAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797756.1
MACVKLGSKTEAFQRQGQAWFCTSGLPSDVVVEVGEMSFHLHKFPLLSRSGVMERLVEEASKGEEGCVIKLPDIPGGAKTFETVAKFCYGVKLELTAANVVYLRCAAEHLEMTEEYGEGNLISQTESFLDQVVLDNWNDSLRALQTCDDILTYAEQLDIPRRCIDSLAAKACTEQNLLGWPVMERGGPLQSPGGSVLWNGISTGARPKSSNSEDWWYDDASVLSFDLYKRLILAMESQGVKQEIIAGSLNSYAKKYLPGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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