当前解析结果
SmilChr02G002554| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002554 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002554 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002554 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 44444489 - 44446498 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131013647 |
|---|---|
| GeneID | 131013647 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131013647 |
| 原始查询 | LOC131013647 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | PRLI-interacting factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832112]; symbol=AT5G19900; hit=AT5G19900; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | PRLI-interacting factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832112]; symbol=AT5G19900; hit=AT5G19900; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G19900 (AT5G19900)PRLI-interacting factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832112] identity=56.8; qcov=0.806; evalue=1.71e-103; confidence=high |
| Rice | Os02g0832600- identity=56.3; qcov=0.564; evalue=1.1e-69; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131013647 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057797759.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057797759.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057797759.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057797759.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057797759.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:44445059 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C41 |
Chr2:44445378 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B53 |
Chr2:44445469 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B20,C72 |
Chr2:44445673 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B101,C2,C32,C68,D7 |
Chr2:44446000 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。