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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000047`

染色体: Chr02 坐标: 637594-649458 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000047`
名称	SmilChr02G000047
描述	probable sugar phosphate/phosphate translocator At1g12500
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	637594 - 649458 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013650`
GeneID	`131013650`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013650`
原始查询	`LOC131013650`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable sugar phosphate/phosphate translocator At1g12500
产物	probable sugar phosphate/phosphate translocator At1g12500
Arabidopsis	`AT1G12500` (AT1G12500) Nucleotide-sugar transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837807] identity=66.9; qcov=0.675; evalue=1.3e-106; confidence=high
Rice	`Os03g0286300` - identity=56.2; qcov=0.632; evalue=2.48e-83; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0015297 (antiporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF03151 (TPT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013650

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057797761.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057797761.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797761.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797761.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797761.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:637721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B25,C1
`Chr2:637989`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	50	A24,B114,B12,B121,B125,B136,B137,B16,B24,B29,B34,B35,B41,B45,B47,B49,B5,B53,B59,B60,B61,B65,B73,B78,B84,B93,B94,C18,C19,C2,C24,C25,C27,C34,C35,C38,C4,C42,C51,C55,C59,C60,C65,C68,C72,C76,C83,D10,D11,D2
`Chr2:637997`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B121,B49,C19,C72
`Chr2:637997`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B121,B49,C19,C72
`Chr2:638044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:643506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A6,A7,B125,B90,B91,B95,C11,C21,C26,C44,C53,C69,C73,D7
`Chr2:643548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C83,D2
`Chr2:643600`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	65	A10,A20,A21,A22,A24,A5,B1,B105,B106,B113,B119,B12,B120,B122,B123,B128,B130,B131,B19,B28,B31,B38,B39,B40,B42,B43,B48,B52,B55,B56,B57,B58,B6,B65,B70,B75,B77,B8,B85,B9,B96,B99,C12,C15,C2,C23,C27,C30,C32,C39,C47,C49,C50,C52,C54,C59,C65,C67,C68,C7,C71,C79,C85,D11,D4
`Chr2:643636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	101	A13,A14,A15,A22,A23,A24,A25,A3,A5,A9,B100,B102,B103,B108,B112,B115,B117,B121,B123,B124,B125,B128,B129,B134,B138,B14,B15,B18,B2,B20,B22,B24,B26,B30,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B45,B46,B48,B49,B5,B50,B53,B61,B62,B63,B64,B68,B69,B70,B72,B76,B77,B78,B79,B80,B82,B96,C11,C16,C18,C19,C20,C22,C23,C25,C26,C28,C29,C31,C32,C33,C37,C40,C42,C44,C45,C46,C48,C5,C54,C58,C67,C68,C69,C70,C71,C72,C74,C78,C79,C80,C82,C9,D10,D5,D9
`Chr2:643683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B32,B33,B46,C30
`Chr2:643691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,B94
`Chr2:643725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797761.1

372 aa

186

372

TPT

PF03151 TPT 144-358 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797761.1`	Pfam	`PF03151`	TPT	Family	144	358	1.8e-23	84.0	Triose-phosphate Transporter family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941778.1
ATGGAAAGATTTCTCCACTGCAGCAGCACTCGAGAAGATCTGGCAGTCATGTGCAACTTGAGAAACTTGCAAACACTTCAGGTTATGAAGATTTCCAGTGGATTTGCTGAGCAAGAGGCTTGCATTCCCCACTTGCCTAAACAAGTTGTGCTTGTGAAACTGCAGCCTCGCTCGAGAAGATCTGGCAACGATTGGTTCGTTGCCACATCTACAAACGCCTCTGCTTTTCGAGTTCTTGAAAAGCTAGTTGCTCGAGATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013650
ATGGAAAGATTTCTCCACTGCAGCAGCACTCGAGAAGATCTGGCAGTCATGTGCAACTTGAGAAACTTGCAAACACTTCAGGTTATGAAGATTTCCAGTGGATTTGCTGAGCAAGAGGCTTGCATTCCCCACTTGCCTAAACAAGTTGTGCTTGTGAAACTGCAGCCTCGCTCGAGAAGATCTGGCAACGATTGGTTCGTTGCCACATCTACAAACGCCTCTGCTTTTCGAGTTCTTGAAAAGCTAGTTGCTCGAGATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797761.1
MERFLHCSSTREDLAVMCNLRNLQTLQVMKISSGFAEQEACIPHLPKQVVLVKLQPRSRRSGNDWFVATSTNASAFRVLEKLVARDLWQLQEIPSGIGEINTLKLIHLHHCSESLAISTAGQHRLVRNVTNVPFQPIHNRRRXFLKILALMPXLSFSVICGNTSLRYLPISFNQAISATTPFFTAIFAFLITCKTESTEVYADLVPIVLASNNEPLFHLFSFLMCVGSIAGRALKSIVQGLLLTSKVEKLHSMNLLLYMA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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