当前解析结果
SmilChr01G006044| 统一新 Gene ID | SmilChr01G006044 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G006044 |
| 描述 | malate dehydrogenase [NADP], chloroplastic-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 75957755 - 75958865 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131013738 |
|---|---|
| GeneID | 131013738 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131013738 |
| 原始查询 | LOC131013738 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | malate dehydrogenase [NADP], chloroplastic-like |
| 产物 | malate dehydrogenase [NADP]%2C chloroplastic-like |
| Arabidopsis | AT5G58330 (AT5G58330)lactate/malate dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835945] identity=65.7; qcov=0.779; evalue=6.59e-35; confidence=medium |
| Rice | Os08g0562100- identity=75.4; qcov=0.435; evalue=1.27e-24; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131013738 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057797807.1 |
| 2 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.80000 | XP_057797807.1 |
| 3 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 0.80000 | XP_057797807.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057797807.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057797807.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:75958016 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A21 |
Chr1:75958652 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A15,C59,C63,D10 |
Chr1:75958668 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B80,C16 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。