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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000404`

染色体: Chr01 坐标: 8235658-8236416 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000404`
名称	SmilChr01G000404
描述	uncharacterized SmilChr01G000404
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	8235658 - 8236416 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013791`
GeneID	`131013791`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013791`
原始查询	`LOC131013791`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=28.9; qcov=0.782; evalue=1.64e-23; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013791

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057797811.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057797811.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057797811.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797811.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797811.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:8235677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:8235692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C32,C68
`Chr1:8235692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr1:8235720`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	C65,C82,C9
`Chr1:8235720`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	C65,C82,C9
`Chr1:8235747`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A15,B136,C76
`Chr1:8235747`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A15,B136,C76
`Chr1:8235753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B78,D11
`Chr1:8235765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A20,A22,B10,B100,B11,B111,B132,B17,B22,B37,B56,B62,B63,B73,B79,B92,B96,C32,C36,C40,C43,C62,C64,C66
`Chr1:8235777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B123,D6
`Chr1:8235777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,D6
`Chr1:8235779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797811.1

252 aa

126

252

Ty3_capsid

PEG10_N-capsid

PF19259 Ty3_capsid 29-195 aa PF03732 PEG10_N-capsid 33-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797811.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	29	195	1.4e-11	44.9	Ty3 transposon capsid-like protein
`XP_057797811.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	33	111	4.4e-15	56.5	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941828.1
ATGGCAAGAAACTGCAATGCTAACCGCAACCAAGAAGAGCTGGAACAACTGGCACTCGAACGGATGGACAACTTAATCAAAAGTTTCCAGAAAAAGAAGCCCCCAACTTACAATGGAACAGGGAAGCCTGATGATGCTAAGGAATGGATCCACGGGATTGAAAAAGTCTTCGGACGCATGCGCTGCAGTACACATGAGAAGGTGGTCTGTGCCACCTACCAGCTCGAGGGAGAAGCAGATCTATGGTGGGAATCTGTGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013791
ATGGCAAGAAACTGCAATGCTAACCGCAACCAAGAAGAGCTGGAACAACTGGCACTCGAACGGATGGACAACTTAATCAAAAGTTTCCAGAAAAAGAAGCCCCCAACTTACAATGGAACAGGGAAGCCTGATGATGCTAAGGAATGGATCCACGGGATTGAAAAAGTCTTCGGACGCATGCGCTGCAGTACACATGAGAAGGTGGTCTGTGCCACCTACCAGCTCGAGGGAGAAGCAGATCTATGGTGGGAATCTGTGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797811.1
MARNCNANRNQEELEQLALERMDNLIKSFQKKKPPTYNGTGKPDDAKEWIHGIEKVFGRMRCSTHEKVVCATYQLEGEADLWWESVRRTFTNEAFETMTWDEFKEAYLTRYITLSFRHKRENEVWKLRQGNCSVEEYDRAFNQLARYAPAHVDTDAKRAEQFRQGLRPEIGVPLSTHDTLTYAQALSKALNAEAQLPEEERRQEKRKWEGPQGQSSNQNSKGKKPWARSNQPNYQKPQVTLWGMQARDDRLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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