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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001858`

染色体: Chr03 坐标: 25629041-25636527 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001858`
名称	SmilChr03G001858
描述	shaggy-related protein kinase kappa
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	25629041 - 25636527 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013926`
GeneID	`131013926`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013926`
原始查询	`LOC131013926`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	shaggy-related protein kinase kappa
产物	shaggy-related protein kinase kappa
Arabidopsis	`AT1G09840` (SK41) shaggy-like protein kinase 41 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837516] identity=86.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0841800` (GL3.3) - identity=84.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007165 (signal transduction)
KEGG	smil04517 (IgSF CAM signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04518 (Integrin signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04519 (Cadherin signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013926

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797835.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797835.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057797835.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057797835.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797835.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:25630644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr3:25631083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr3:25634628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797835.1

423 aa

212

423

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 87-369 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 88-287 aa

XP_057797836.1

423 aa

212

423

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 87-369 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 88-287 aa

XP_057797837.1

423 aa

212

423

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 87-369 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 88-287 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797835.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	87	369	4e-62	210.7	Protein kinase domain
`XP_057797835.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	88	287	6.8e-25	88.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057797836.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	87	369	4e-62	210.7	Protein kinase domain
`XP_057797836.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	88	287	6.8e-25	88.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057797837.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	87	369	4e-62	210.7	Protein kinase domain
`XP_057797837.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	88	287	6.8e-25	88.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941852.1
GAGGAGTCTGGGAAAGACAGAGCAGTGAATTAGTACCTAAAATGAATTTCTCCTTTTAACCTTTTATCAGCAATTCAGGGACTGCAGCTCATCTCACTCGACACTCCACACGCGCCCCCTTTCATCTTCCAACAAACTCCTCAACTGTAGTTTTTCCTTTCCCCTTCCTTCTCCGGCCTTGCCGTCCACCACCGTCATGCCCCCTCACCATTCCCTCACACACCCACGCAGAGCTCCGATTTCTGAATAGATTCGAGGAA...

XM_057941854.1
AGTACCTAAAATGAATTTCTCCTTTTAACCTTTTATCAGCAATTCAGGGACTGCAGCTCATCTCACTCGACACTCCACACGCGCCCCCTTTCATCTTCCAACAAACTCCTCAACTGTAGTTTTTCCTTTCCCCTTCCTTCTCCGGCCTTGCCGTCCACCACCGTCATGCCCCCTCACCATTCCCTCACACACCCACGCAGAGCTCCGATTTCTGAATAGATTCGAGGAAAGCTCGAAATTCCTAAGAGGTTCCCTCCCAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131013926
ATGGCATCTGCTGGCCTAGGACATGGAGGAGCTGGAAGTTCAAGATCTGCTAATAATGGCTTCAAAGTCTCATCTAGTTCAGTTGACTGGTTGGGAAGAGAGATGCTTGAAATGAGATTGAGGGACAGAGTGGACCCTGATGATGACAGGGACAGTGAACCTGATGTAATTGATGGTGTGGGTGCTGAAACAGGGCATGTAATAAGGACCACCATTGGTGGCCGGAATGGTCAATCCAAGCAGGTGGTAAGCTATATTGC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057797835.1
MASAGLGHGGAGSSRSANNGFKVSSSSVDWLGREMLEMRLRDRVDPDDDRDSEPDVIDGVGAETGHVIRTTIGGRNGQSKQVVSYIAEHVVGTGSFGVVFQAKCRETGEIVAIKKVLQDKRYKNRELQIMQMLDHPNIVALKHSFFAKTEKEELYLNLVLEYVPETVNRIARQYSRMNQRMPLIYVKLYTYQICRALAYIHNCIGICHRDIKPQNLLVNPHTHQLKLCDFGSAKVLVKGEPNVSYICSRYYRAPELIFGA...

XP_057797836.1
MASAGLGHGGAGSSRSANNGFKVSSSSVDWLGREMLEMRLRDRVDPDDDRDSEPDVIDGVGAETGHVIRTTIGGRNGQSKQVVSYIAEHVVGTGSFGVVFQAKCRETGEIVAIKKVLQDKRYKNRELQIMQMLDHPNIVALKHSFFAKTEKEELYLNLVLEYVPETVNRIARQYSRMNQRMPLIYVKLYTYQICRALAYIHNCIGICHRDIKPQNLLVNPHTHQLKLCDFGSAKVLVKGEPNVSYICSRYYRAPELIFGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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