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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001906`

染色体: Chr03 坐标: 26653923-26662440 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001906`
名称	SmilChr03G001906
描述	protein TRAUCO-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	26653923 - 26662440 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013962`
GeneID	`131013962`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013962`
原始查询	`LOC131013962`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TRAUCO-like
产物	protein TRAUCO-like
Arabidopsis	`AT1G51450` (TRO) TRAUCO [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841570] identity=66.1; qcov=0.65; evalue=7.25e-152; confidence=high
Rice	`Os12g0143200` - identity=58.5; qcov=0.557; evalue=2.3e-115; confidence=medium
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0048188 (Set1C/COMPASS complex); GO:0051568 (GO:0051568)
KEGG	-
Pfam	PF00622 (SPRY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013962

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797883.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057797884.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797883.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797883.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797883.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:26654139`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B107
`Chr3:26654139`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B107
`Chr3:26654154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C1
`Chr3:26654158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr3:26654329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B26,B28
`Chr3:26654733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr3:26654787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B9,C33,C58
`Chr3:26654865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B68,B77
`Chr3:26655376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr3:26656254`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B138
`Chr3:26657003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr3:26657007`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797883.1

475 aa

238

475

SPRY

PF00622 SPRY 256-331 aa

XP_057797884.1

531 aa

266

531

SPRY

PF00622 SPRY 312-387 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797883.1`	Pfam	`PF00622`	SPRY	Domain	256	331	2.6e-14	54.1	SPRY domain
`XP_057797884.1`	Pfam	`PF00622`	SPRY	Domain	312	387	3.9e-14	53.5	SPRY domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941901.1
AGACAATTTGAGAAAGAGAGAAATTTAGAAGGAAAGAGATTGAGAGTGTTTGTTCATTGGAGTTGAGATAGGATTCGAAGATCGTTGCCATCCAACGTCGAATCTTGCCGTGGGAACAATTCGGAAGATCAACTCTGGAGTCGATCACTTCTCGTTTCGCAGGTATACTTCTTTTACTACCTTGTAAGATTATGGTTTTTGTATGTACTTGTTAGATATTCGAAATGGATCGTGGGCACACGAACCGTATATCAAAATAT...

XM_057941900.1
CACGAACCGTATATCAAAATATGGTTCCTACACACGTGTGCCAAAAGGATCTTAGGTGTGCAAACTGACAATGCTTTGAATTACTTGATTGTTGCCGTCGTCGTCATCCTCTCTGTATTCCCTCCAATTCCAATGGACACTCTTCAGGCCACCTACAGAGAGGATGACGACGACGCCACCAACGCCTCCCCTTCGCCACCCACACCCACTGCCACCCTCGACGCTGGAGCCGCCGCAACCGCTGCCGAGTTGCCTGAAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131013962
ATGTACTTGTTAGATATTCGAAATGGATCGTGGGCACACGAACCGTATATCAAAATATGGTTCCTACACACGTGTGCCAAAAGGATCTTAGGTGTGCAAACTGACAATGCTTTGAATTACTTGATTGTTGCCGTCGTCGTCATCCTCTCTGTATTCCCTCCAATTCCAATGGACACTCTTCAGGCCACCTACAGAGAGGATGACGACGACGCCACCAACGCCTCCCCTTCGCCACCCACACCCACTGCCACCCTCGACGC...

LOC131013962
ATGGACACTCTTCAGGCCACCTACAGAGAGGATGACGACGACGCCACCAACGCCTCCCCTTCGCCACCCACACCCACTGCCACCCTCGACGCTGGAGCCGCCGCAACCGCTGCCGAGTTGCCTGAAAACGGAATCAAGGACGAGCCAGACGTCGCCATCTCCGAAGACGTTTCGTCCGAAGAGGCCTCCGTGTACGGAACGCCGCAAGCTCTAGACGCTGACCAGCACGATTCGCATAATTCCCCAAATCGCCCCCCCGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057797883.1
MDTLQATYREDDDDATNASPSPPTPTATLDAGAAATAAELPENGIKDEPDVAISEDVSSEEASVYGTPQALDADQHDSHNSPNRPPELELEGDEDAELDEEDDEPSPKKQKQLSDLPKPAAAALEITETPSPAATPAQDGKPLALAAKSGKKSKKKNKDVWTTTSRKGKKKTKQASNNNHNSKNPMNGDALAEDRVFISPIPRFPDKSDDFPELEICLSKVYKAEKVELSEDRMSASSTKGYRMVRATRGVTEGAWYFEI...

XP_057797884.1
MYLLDIRNGSWAHEPYIKIWFLHTCAKRILGVQTDNALNYLIVAVVVILSVFPPIPMDTLQATYREDDDDATNASPSPPTPTATLDAGAAATAAELPENGIKDEPDVAISEDVSSEEASVYGTPQALDADQHDSHNSPNRPPELELEGDEDAELDEEDDEPSPKKQKQLSDLPKPAAAALEITETPSPAATPAQDGKPLALAAKSGKKSKKKNKDVWTTTSRKGKKKTKQASNNNHNSKNPMNGDALAEDRVFISPIPRF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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