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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001913`

染色体: Chr03 坐标: 26778138-26781063 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001913`
名称	SmilChr03G001913
描述	uncharacterized SmilChr03G001913
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	26778138 - 26781063 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013963`
GeneID	`131013963`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013963`
原始查询	`LOC131013963`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0129000; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os02g0129000; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G40087` (AT1G40087) Plant transposase (Ptta/En/Spm family) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840721] identity=22.6; qcov=0.792; evalue=4.25e-09; confidence=weak
Rice	`Os02g0129000` - identity=24.5; qcov=0.665; evalue=1.77e-12; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013963

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797886.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797886.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797886.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797886.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057797886.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:26779160`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B25
`Chr3:26779160`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B25
`Chr3:26779181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,C66
`Chr3:26779221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B8
`Chr3:26779223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C45
`Chr3:26779226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B137,B24,B45,B53,B57,B63,B68,B85,C14,C36,C7
`Chr3:26779476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B87,D1
`Chr3:26779496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C83
`Chr3:26779506`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A23,B140,B15
`Chr3:26779506`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A23,B140,B15
`Chr3:26779510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B97
`Chr3:26779524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B65,B72,B80,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797886.1

442 aa

221

442

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 162-289 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797886.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	162	289	3.8e-24	86.1	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941903.1
AAGGCCATGTGAAACTGACAAGAATGGGAATGAAACCTAGTGATGTTTTCAAGCTGGCTAAAGGTTTGAGAATTTTGGTAAATGTCAATGAACATGGCCAACCGATCCGAGCAGCTAGAAGAGTTCTAACAAGATACATGATGAAACTTGTTAAACAACCAAATCTTTGTCCGCCAGATTTAAATGATTTTAATGATGTTAAACATGCCTTTGGAGTTGAGCTGCTGAGAGCTGTGAGGGAGAAATTCTATATCCCTAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013963
ATGGGAATGAAACCTAGTGATGTTTTCAAGCTGGCTAAAGGTTTGAGAATTTTGGTAAATGTCAATGAACATGGCCAACCGATCCGAGCAGCTAGAAGAGTTCTAACAAGATACATGATGAAACTTGTTAAACAACCAAATCTTTGTCCGCCAGATTTAAATGATTTTAATGATGTTAAACATGCCTTTGGAGTTGAGCTGCTGAGAGCTGTGAGGGAGAAATTCTATATCCCTAGACATGAAAATGTGGACAATGTATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797886.1
MGMKPSDVFKLAKGLRILVNVNEHGQPIRAARRVLTRYMMKLVKQPNLCPPDLNDFNDVKHAFGVELLRAVREKFYIPRHENVDNVLIALMGIKFRNNKYRIRKEIYKKTHARLREKLKVVLEASGVHGEELEHRVIFHEFREDQILAELDRVEPPPGFANHQWLKFKSNMKSEKAKKLSEKGKKARATQSHTHTTGTKSYAQVEDEHVIKYKEHPGPLTFFDLTHKRRDGSYVQSDSKEFMIAAKSEIVRRKNEGTCEN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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