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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001933`

染色体: Chr03 坐标: 27300708-27302257 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001933`
名称	SmilChr03G001933
描述	serine/threonine-protein kinase UCN-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	27300708 - 27302257 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013984`
GeneID	`131013984`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013984`
原始查询	`LOC131013984`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase UCN-like
产物	serine/threonine-protein kinase UCN-like
Arabidopsis	`AT1G51170` (UCN) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841540] identity=57.9; qcov=1.07; evalue=2.22e-149; confidence=high
Rice	`Os08g0504800` - identity=48.9; qcov=1.1; evalue=6.45e-110; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013984

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797908.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797908.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057797908.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797908.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797908.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:27301171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B36,C17,C75,C76
`Chr3:27301434`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C30,C76
`Chr3:27301641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr3:27301684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B59,B71
`Chr3:27301956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:27301977`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B17
`Chr3:27301977`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B17
`Chr3:27302032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B124

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797908.1

367 aa

184

367

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 14-163 aa PF00069 Pkinase 16-163 aa PF00069 Pkinase 206-310 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797908.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	14	163	7.3e-23	81.9	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057797908.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	16	163	3e-53	181.6	Protein kinase domain
`XP_057797908.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	206	310	3e-53	181.6	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941925.1
GCAGAACCCAACGTAAAAAAATAGTGGAGGCCACCTAAAAAATTCTTTAAGGGCTCTTGTATCCCAAACAAACCCGTACGTACAGTGCCAACGCACTAACTCCAATATCCACAATCCCAACACATACGGCCCCGCCTTGTCTGTGTTTTGTTGGTGTTGGTCTAATTAGAATATACACACACATGTGTGCACAATCGTGCAATATATATGATCTCCTCTCGCGGAGCCCAAACACTAACAGTAATCCCCTCGTGAAATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013984
ATGGATACTCCGCCGCCGCTGCTCCACATAGACAACCTACGCGCTGTCAAGGTACTCGGCAAAGGCGCCACCGGCACGGTATTCCTCGTCCACGACAAGTCCGGCGGCCAGCCCTTCGCCCTCAAGGTAGCCGAGAAATCCTCCGCCCACCGCCGCGCCCGCCACGAGATCTCTGTCCTCCGCCGCCTCCCTCCCCACCCCCTCCTGCCACACCTGATCTGCTCCTTCGAGGACGACGAGTTCATCTGCTGGGGCATCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797908.1
MDTPPPLLHIDNLRAVKVLGKGATGTVFLVHDKSGGQPFALKVAEKSSAHRRARHEISVLRRLPPHPLLPHLICSFEDDEFICWGIPFCPGGDLNVLRHRQSDRVFSPAVIRFYLAEIVCALQHLHQQGIVYRDLKPENILVQLSGHVTLTDFDLSRDLAVRKSHFSSHTIPKSNTRSRFALGKKKAKSARVSPVSRRNPIEDFSANERSNSFVGTEEYVAPEMIRGDGHEFSVDWWALGVLAYEMLYGTTPFKGRNRKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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