当前解析结果
SmilChr03G001935| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001935 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001935 |
| 描述 | zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein 5-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 27410570 - 27411523 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131013985 |
|---|---|
| GeneID | 131013985 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131013985 |
| 原始查询 | LOC131013985 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein 5-like |
| 产物 | zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein 5-like |
| Arabidopsis | AT3G12630 (SAP5)A20/AN1-like zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820443] identity=43.2; qcov=1.12; evalue=1.21e-36; confidence=medium |
| Rice | Os09g0486500 (SAP1)- identity=65.2; qcov=0.479; evalue=7.69e-29; confidence=medium |
| GO | GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0016567 (protein ubiquitination) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01428 (zf-AN1) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131013985 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057797909.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057797909.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.40000 | XP_057797909.1 |
| 4 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057797909.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057797909.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057797909.1PF01428
zf-AN1 83-122 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057797909.1 |
Pfam | PF01428 |
zf-AN1 | Domain | 83 | 122 | 1.1e-11 | 45.4 | AN1-like Zinc finger |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。