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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001941`

染色体: Chr03 坐标: 27621750-27630256 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001941`
名称	SmilChr03G001941
描述	protein TRAUCO-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	27621750 - 27630256 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013991`
GeneID	`131013991`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013991`
原始查询	`LOC131013991`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TRAUCO-like
产物	protein TRAUCO-like
Arabidopsis	`AT1G51450` (TRO) TRAUCO [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841570] identity=66.1; qcov=0.726; evalue=1.3e-153; confidence=high
Rice	`Os12g0143200` - identity=58.5; qcov=0.623; evalue=1.59e-116; confidence=high
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0048188 (Set1C/COMPASS complex); GO:0051568 (GO:0051568)
KEGG	-
Pfam	PF00622 (SPRY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013991

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797911.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797911.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797911.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797911.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057797911.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:27628171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr3:27628183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B16
`Chr3:27628249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B8,B91,C31
`Chr3:27628310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr3:27629302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr3:27629451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr3:27629467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr3:27629818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr3:27629857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B74,B77,C48
`Chr3:27629874`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B113
`Chr3:27629874`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B113
`Chr3:27629875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B123,B35,B46,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797911.1

475 aa

238

475

SPRY

PF00622 SPRY 256-331 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797911.1`	Pfam	`PF00622`	SPRY	Domain	256	331	2.6e-14	54.1	SPRY domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941928.1
TTTTGATGTACCGTGCACGCGGTGAAAGTGATAAGAGAAACCAGAATTTATTTGTTTTTTGAACCCATAAGTTGTTGATTGTTAAGACTTAGAAGTACTCATTGCTGTATTCCCTCCAATTCCAATGGACACTCTTCAGGCCACCTACAGAGAGGATGACGACGACGCCACCAACGCCTCCCCTTCGCCACCCACACCCACTGCCACCCTCGACGCTGGAGCCGCCGCAACCGCTGCCGAGTTGCCTGAAAACGGAATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013991
ATGGACACTCTTCAGGCCACCTACAGAGAGGATGACGACGACGCCACCAACGCCTCCCCTTCGCCACCCACACCCACTGCCACCCTCGACGCTGGAGCCGCCGCAACCGCTGCCGAGTTGCCTGAAAACGGAATCAAGGACGAGCCAGACGTCGCCATCTCCGAAGACGTTTCGTCCGAAGAGGCCTCCGTGTACGGAACGCCGCAAGCCCTAGACGCTGACCAGCACGATTCGCATAATTCCCCAAATCGCCCCCCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797911.1
MDTLQATYREDDDDATNASPSPPTPTATLDAGAAATAAELPENGIKDEPDVAISEDVSSEEASVYGTPQALDADQHDSHNSPNRPPELELEGDEDAELDEEDDEPSPKKQKQLSDLPKPAAAALEITETPSPAATPAQDGKPLALAAKSGKKSKKKNKDVWTTTSRKGKKKTKQASNNNHNSKNPMNGDALAEDRVFISPIPRFPDKSDDFPELEICLSKVYKAEKVELSEDRMSASSTKGYRMVRATRGVTEGAWYFEI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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