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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001976`

染色体: Chr03 坐标: 28603574-28609243 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001976`
名称	SmilChr03G001976
描述	glutamate--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	28603574 - 28609243 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014019`
GeneID	`131014019`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014019`
原始查询	`LOC131014019`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutamate--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial-like
产物	glutamate--tRNA ligase%2C chloroplastic/mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G64050` (ERS) glutamate tRNA synthetase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836526] identity=85.4; qcov=0.477; evalue=1.77e-19; confidence=low
Rice	`Os02g0121000` - identity=78; qcov=0.477; evalue=2.82e-17; confidence=low
GO	GO:0004818 (glutamate-tRNA ligase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006424 (glutamyl-tRNA aminoacylation)
KEGG	-
Pfam	PF00749 (tRNA-synt_1c)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014019

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057797940.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057797940.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057797940.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797940.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797940.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:28608427`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	49	A1,A18,A19,A21,A25,A6,B1,B100,B110,B119,B133,B135,B139,B14,B140,B27,B31,B35,B44,B45,B51,B53,B65,B66,B7,B71,B77,B89,B90,B92,B99,C10,C17,C21,C23,C26,C29,C6,C7,C70,C72,C74,C83,C87,D1,D10,D11,D2,D6
`Chr3:28608449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B35,B37,B79,B94
`Chr3:28608596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797940.1

96 aa

tRNA-synt_1c

PF00749 tRNA-synt_1c 8-69 aa

XP_057797941.1

86 aa

tRNA-synt_1c

PF00749 tRNA-synt_1c 8-57 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797940.1`	Pfam	`PF00749`	tRNA-synt_1c	Domain	8	69	3.8e-11	43.2	tRNA synthetases class I (E and Q), catalytic domain
`XP_057797941.1`	Pfam	`PF00749`	tRNA-synt_1c	Domain	8	57	2.5e-07	30.7	tRNA synthetases class I (E and Q), catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941957.1
CCCAGTTCCTCCGCCACCAGCCCCTAGTCAGTTTCCATTAAAATTGTTGTTAATTCCAGTTTATTAAATCAATTATTAGATATTTATTTTATCAGTAAAACCAAAGTAAAAGATATTTACTTATTTTACTTTATTGATTTAGTTGATATGTATGAAAAATATATTTTGAAATGAGAGTGGAAGAGGTTTGTGTTGATTTTATATTTTAGTGTGTGTTCAATTGCACAAGATTTGGACCTGCAGATTCTAACAGGATGGAA...

XM_057941958.1
CCCAGTTCCTCCGCCACCAGCCCCTAGTCAGTTTCCATTAAAATTGTTGTTAATTCCAGTTTATTAAATCAATTATTAGATATTTATTTTATCAGTAAAACCAAAGTAAAAGATATTTACTTATTTTACTTTATTGATTTAGTTGATATGTATGAAAAATATATTTTGAAATGAGAGTGGAAGAGGTTTGTGTTGATTTTATATTTTAGTGTGTGTTCAATTGCACAAGATTTGGACCTGCAGATTCTAACAGGATGGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014019
ATGGAAGCTTTGAACAGCCGGCTCCAATTTCAGCGCTTTTATTTTTATAAGGTATGTTGGAATCTTAACACACTTAGAGATTTTGTGGTTATGAGAAGTAAAGGGCAACCTGTATACAACTTTTGTGTAACCGTTGATGATGCTACCATGGCTATCTCAAATGCCATTAGAGCTGAAGAGTACTTGCCAAATACTTTGAGAAAATTAGCGATCGGAATAGAGAGAATAGAAAAAGGAGAAAGCCGACTTTGTACATGTGG...

LOC131014019
ATGGAAGCTTTGAACAGCCGGCTCCAATTTCAGCGCTTTTATTTTTATAAGGTATGTTGGAATCTTAACACACTTAGAGATTTTGTGGTTATGAGAAGTAAAGGGCAACCTGTATACAACTTTTGTGTAACCGTTGATGATGCTACCATGGCTATCTCAAATGCCATTAGAAAATTAGCGATCGGAATAGAGAGAATAGAAAAAGGAGAAAGCCGACTTTGTACATGTGGAGATGGATTGAAGCCACTATCCAAAAGATG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057797940.1
MEALNSRLQFQRFYFYKVCWNLNTLRDFVVMRSKGQPVYNFCVTVDDATMAISNAIRAEEYLPNTLRKLAIGIERIEKGESRLCTCGDGLKPLSKR

XP_057797941.1
MEALNSRLQFQRFYFYKVCWNLNTLRDFVVMRSKGQPVYNFCVTVDDATMAISNAIRKLAIGIERIEKGESRLCTCGDGLKPLSKR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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