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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006119`

染色体: Chr01 坐标: 76718912-76777689 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006119`
名称	SmilChr01G006119
描述	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RGI2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76718912 - 76777689 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014037`
GeneID	`131014037`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014037`
原始查询	`LOC131014037`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RGI2
产物	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RGI2
Arabidopsis	`AT3G56370` (AT3G56370) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824804] identity=40.5; qcov=0.873; evalue=6.34e-24; confidence=medium
Rice	`Os03g0228800` - identity=37.5; qcov=0.972; evalue=8.91e-27; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF12799 (LRR_4); PF13516 (LRR_6); PF13855 (LRR_8); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014037

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057797949.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057797949.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057797949.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797949.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797949.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76719004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr1:76719376`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B94,C26
`Chr1:76719376`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B94,C26
`Chr1:76719379`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B94,C26
`Chr1:76719379`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B94,C26
`Chr1:76719400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B110,B13,B65,C71
`Chr1:76719421`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A16,B110,B126,B129,B13,B65,C45,C71
`Chr1:76719425`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A16,B110,B126,B129,B13,B65,C45,C71
`Chr1:76719459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr1:76777373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr1:76777395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,D11
`Chr1:76777407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797949.1

181 aa

181

LRR_6

LRR_1

LRR_At5g56370

LRR_8

LRR_4

LRR_1

PF13516 LRR_6 43-57 aa PF00560 LRR_1 44-64 aa PF24758 LRR_At5g56370 49-143 aa PF13855 LRR_8 91-130 aa PF12799 LRR_4 94-130 aa PF00560 LRR_1 96-117 aa PF00560 LRR_1 119-140 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797949.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	43	57	4.6e-05	23.9	Leucine Rich repeat
`XP_057797949.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	44	64	4.1e-17	59.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057797949.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	49	143	5.9e-09	36.6	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats
`XP_057797949.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	91	130	1.4e-15	57.4	Leucine rich repeat
`XP_057797949.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	94	130	2.8e-13	50.4	Leucine Rich repeats (2 copies)
`XP_057797949.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	96	117	4.1e-17	59.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057797949.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	119	140	4.1e-17	59.3	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941966.1
GAAAGAGATTGGTTATCTTAATTATTTAGAGGTATTGAGGATGAGCAACAACAATCTCAGTGGACGATTACCAAGACAACTTTGGAATGTCACGACTCTTCGTGAATTATACATTGCCAACATCTCTTTAACTGCAGGTGGTATTCCGAAAGAGATTGTTTATCTTAATAATTTAGAGATATTAGACATGAGTGACAACAATCTTAGTGGACCATTTCCAAGACAAATCTTGAACATCACAAGTCTCCGTCAACTATACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014037
ATGAGCAACAACAATCTCAGTGGACGATTACCAAGACAACTTTGGAATGTCACGACTCTTCGTGAATTATACATTGCCAACATCTCTTTAACTGCAGGTGGTATTCCGAAAGAGATTGTTTATCTTAATAATTTAGAGATATTAGACATGAGTGACAACAATCTTAGTGGACCATTTCCAAGACAAATCTTGAACATCACAAGTCTCCGTCAACTATACCTTGGTGGCGCCTCTTTAAATGGTCGGCTACCAAAGGACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797949.1
MSNNNLSGRLPRQLWNVTTLRELYIANISLTAGGIPKEIVYLNNLEILDMSDNNLSGPFPRQILNITSLRQLYLGGASLNGRLPKDICSHNNLQRLKLLDLSSNKLQGDIPSSLYQCPQLESIDLSDNNFSGYVSAQIWNITLLKVLDLTSNNLIDFGVNGKATALASNDIIQFLNNMMYI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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