当前解析结果
SmilChr03G002002| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002002 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002002 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002002 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 29848727 - 29852987 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131014039 |
|---|---|
| GeneID | 131014039 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014039 |
| 原始查询 | LOC131014039 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014039 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057797948.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057797947.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057797948.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057797947.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057797947.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:29848935 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B121,B51,B66,C17,C68 |
Chr3:29848947 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 14 | A24,A7,A9,B104,B106,B113,B125,C17,C4,C44,C54,C61,C73,D7 |
Chr3:29848976 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | C52,D7 |
Chr3:29848976 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C52,D7 |
Chr3:29849347 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 11 | A11,B16,B31,B83,C1,C46,C48,C59,C6,D6,D9 |
Chr3:29850263 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B134 |
Chr3:29850263 |
CT |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B134 |
Chr3:29850286 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B126,B88,C51 |
Chr3:29850291 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A4,B21,B95,C31,C53 |
Chr3:29850307 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr3:29850340 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B64,C11 |
Chr3:29850350 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B26 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
12 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。