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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002010`

染色体: Chr03 坐标: 30019183-30024234 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002010`
名称	SmilChr03G002010
描述	glutathione S-transferase T1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	30019183 - 30024234 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014045`
GeneID	`131014045`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014045`
原始查询	`LOC131014045`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutathione S-transferase T1-like
产物	glutathione S-transferase T1-like
Arabidopsis	`AT5G41210` (GSTT1) glutathione S-transferase THETA 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834123] identity=54.7; qcov=0.971; evalue=5.92e-99; confidence=high
Rice	`Os11g0588300` (OsGSTT1) - identity=55.8; qcov=0.929; evalue=5.83e-94; confidence=high
GO	-
KEGG	smil00480 (Glutathione metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02798 (GST_N); PF13409 (GST_N_2); PF13410 (GST_C_2); PF13417 (GST_N_3); PF14497 (GST_C_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014045

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057797952.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057797952.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797952.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797952.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797952.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:30019446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A24,B28,B50
`Chr3:30019501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B86,C22,C41
`Chr3:30019773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C50
`Chr3:30019808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C36
`Chr3:30020058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797952.1

241 aa

120

241

GST_N

GST_N_3

GST_N_2

GST_C_2

GST_C_3

PF02798 GST_N 1-75 aa PF13417 GST_N_3 9-80 aa PF13409 GST_N_2 14-76 aa PF13410 GST_C_2 132-201 aa PF14497 GST_C_3 135-205 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797952.1`	Pfam	`PF02798`	GST_N	Domain	1	75	2e-16	60.8	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057797952.1`	Pfam	`PF13417`	GST_N_3	Domain	9	80	8.2e-11	42.8	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057797952.1`	Pfam	`PF13409`	GST_N_2	Domain	14	76	1.9e-10	41.9	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057797952.1`	Pfam	`PF13410`	GST_C_2	Domain	132	201	9.6e-09	36.0	Glutathione S-transferase, C-terminal domain
`XP_057797952.1`	Pfam	`PF14497`	GST_C_3	Domain	135	205	0.00013	22.8	Glutathione S-transferase, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941969.1
ACGTGAAAGTGGAAGGAGACAGCCAGCAAATCATGTGCCAGCAAGAGCAAAGAAACAGTCCACGTACGTTGTATGCACCATAGTAATATTTAGATTGATATAAAATTGAAAATACACAAAACCACAATTCCATTCCAAAATCTGTATTCCTCTCTGTGAGTCAAGGGGGAAGAAAAATGGAGCTCAAAGTCTACTGCGATCGCCTGTCCCAGCCTTCACGCGCAGTTCTCATCTTCTGCAAAGCAAACGGGATCGAGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014045
ATGGAGCTCAAAGTCTACTGCGATCGCCTGTCCCAGCCTTCACGCGCAGTTCTCATCTTCTGCAAAGCAAACGGGATCGAGTTTGAGGAGGTTACGATTGATCTTGGCAAAGGGCAAAACCGCTCCGCCGAATATTCAGAAGTGAATCCCATGAAACAAGTACCAGCTATTGTGCATGGTGATTTCAAGCTTTTTGAGAGTCATGCAATACTTATTTATCTAGCTTCTGCATTTCCTGGAGTTGCTGATCACTGGTACCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797952.1
MELKVYCDRLSQPSRAVLIFCKANGIEFEEVTIDLGKGQNRSAEYSEVNPMKQVPAIVHGDFKLFESHAILIYLASAFPGVADHWYPADVRQRAKVHAVLDWHHSNLRRGSVGFIFNNTISLAFGIPADSEAAAKGEKLLSACLARIESFWLQDGPFLLGNSKPTLADLALVCEIMQLEAGDLNDRDRIVSPYKRVLKWMEDVKSASAPHFEEVHAIMGPVREHLKQLKIQATHKSDSTEN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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