当前解析结果
SmilChr03G002038| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002038 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002038 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002038 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 30746964 - 30751701 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131014050 |
|---|---|
| GeneID | 131014050 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014050 |
| 原始查询 | LOC131014050 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014050 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057797957.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057797957.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057797957.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057797957.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057797957.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:30747283 |
CTG |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 30 | A15,A21,A3,B102,B11,B117,B118,B123,B126,B131,B33,B4,B59,B67,B75,B89,B9,B94,B97,B98,B99,C12,C14,C44,C46,C53,C64,C66,C82,D11 |
Chr3:30747287 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B44,D11 |
Chr3:30747308 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B124,B49,B79,B94 |
Chr3:30747318 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | A13 |
Chr3:30747318 |
C |
CT |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | A13 |
Chr3:30747333 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B126,D9 |
Chr3:30747342 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A8,B72 |
Chr3:30747351 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B107 |
Chr3:30747379 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B40,B49,C32,C48,C68 |
Chr3:30747417 |
CGA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 37 | A1,B100,B11,B111,B127,B128,B13,B131,B134,B140,B2,B20,B27,B45,B50,B54,B64,B65,B73,B75,B85,C10,C11,C23,C26,C28,C30,C32,C34,C44,C49,C5,C51,C6,C60,C8,D10 |
Chr3:30747559 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B35,B64,C24,D11 |
Chr3:30747567 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
36 records
下载 cDNA FASTA7 records
下载 CDS FASTA7 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。