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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006140`

染色体: Chr01 坐标: 76909055-76913283 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006140`
名称	SmilChr01G006140
描述	uncharacterized SmilChr01G006140
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76909055 - 76913283 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014074`
GeneID	`131014074`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014074`
原始查询	`LOC131014074`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pleiotropic drug resistance 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843013]; symbol=ABCG39; hit=AT1G66950; species=arabidopsis; confidence=low
产物	pleiotropic drug resistance 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843013]; symbol=ABCG39; hit=AT1G66950; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G66950` (ABCG39) pleiotropic drug resistance 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843013] identity=65.3; qcov=0.363; evalue=2.85e-40; confidence=low
Rice	`Os02g0208300` (OsABCG39) - identity=53.2; qcov=0.392; evalue=8.92e-34; confidence=low
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0140359 (ABC-type transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF01061 (ABC2_membrane)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014074

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057797981.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057797981.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797981.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797981.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797981.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76910018`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B71,B9,C22,C47,D3
`Chr1:76910018`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B71,B9,C22,C47,D3
`Chr1:76910023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B140,B17,C56
`Chr1:76910279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B30,B43,D9
`Chr1:76910294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A14,A2,A20,B101,B103,B104,B106,B120,B123,B16,B53,B65,B99,C11,C12,C24,C30,C45,C46,C47,C52,C69
`Chr1:76910301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B34,C42
`Chr1:76911293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr1:76911318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A10,A2,B111,B114,B62,B91,C29,C58
`Chr1:76911322`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C52,C58
`Chr1:76911322`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C52,C58
`Chr1:76911329`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C52,C58
`Chr1:76911329`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C52,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797981.1

278 aa

139

278

ABC2_membrane

PF01061 ABC2_membrane 156-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797981.1`	Pfam	`PF01061`	ABC2_membrane	Domain	156	260	4.1e-16	59.9	ABC-2 type transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941998.1
ATGGTGCAGAGTGCAGGGAAGAACACTCGCATTGTTCTCCACTCAGTTGGATCGTTGCCGCGATTATTTTATTTTATACACAAAATCAATATTTCTCTCCCTCAATTCCCTAAACCTAAAACCAATTCCTCTTCCCCATTTTCTCACATCCAACTCTCCTCTCCTCGCCGCAATTCGCCGCTCCTAGCAATCCGCCCACTCCTCCCTTCCTGCAGTTCCCGGCGAGCAACGGTGAAGACCGGCACCGCCGTCTCAACCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014074
ATGGTGCAGAGTGCAGGGAAGAACACTCGCATTGTTCTCCACTCAGTTGGATCGTTGCCGCGATTATTTTATTTTATACACAAAATCAATATTTCTCTCCCTCAATTCCCTAAACCTAAAACCAATTCCTCTTCCCCATTTTCTCACATCCAACTCTCCTCTCCTCGCCGCAATTCGCCGCTCCTAGCAATCCGCCCACTCCTCCCTTCCTGCAGTTCCCGGCGAGCAACGGTGAAGACCGGCACCGCCGTCTCAACCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797981.1
MVQSAGKNTRIVLHSVGSLPRLFYFIHKINISLPQFPKPKTNSSSPFSHIQLSSPRRNSPLLAIRPLLPSCSSRRATVKTGTAVSTLGSPSPFPLSTEPRGRSGSRPRPWSSATAPCRHPPHLLPPVSTQALISPDHRHGTAAANGCPEPGTTVVNGCLKELAMTVFRLPVFFKQRDSLFYPAWAFALPIWVLCIPIFVVECALWIIFTYYTIGFALSPVRFFKQLLAFIGVHQMALSLFRFIAVVGRTQVVANTFGTFC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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