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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002141`

染色体: Chr03 坐标: 33343375-33353491 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002141`
名称	SmilChr03G002141
描述	uncharacterized SmilChr03G002141
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	33343375 - 33353491 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014141`
GeneID	`131014141`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014141`
原始查询	`LOC131014141`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820444]; symbol=AT3G12640; hit=AT3G12640; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	RNA binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820444]; symbol=AT3G12640; hit=AT3G12640; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G12640` (AT3G12640) RNA binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820444] identity=39.2; qcov=1.02; evalue=5.18e-123; confidence=medium
Rice	`Os08g0504600` - identity=55; qcov=0.265; evalue=2.83e-49; confidence=weak
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006397 (mRNA processing); GO:0008143 (poly(A) binding); GO:0043488 (regulation of mRNA stability); GO:1900364 (GO:1900364)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF01480 (PWI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014141

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798002.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798002.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798002.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798002.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057798002.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:33343803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B34,B4,B99
`Chr3:33343939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:33344000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B33,C23,C28,C72
`Chr3:33344032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr3:33345716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B75,D9
`Chr3:33345960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C14
`Chr3:33346308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B135,B7
`Chr3:33346427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B83
`Chr3:33346631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C14
`Chr3:33346739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C14
`Chr3:33346758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B129,B132,B2
`Chr3:33346768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B91,B95,B98,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798002.1

679 aa

340

679

PWI

RRM_1

PF01480 PWI 23-81 aa PF00076 RRM_1 508-576 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798002.1`	Pfam	`PF01480`	PWI	Family	23	81	1.1e-06	29.6	PWI domain
`XP_057798002.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	508	576	2.5e-15	56.8	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942019.1
AGGGAAACATTTGTTAAAAGCAAAGTTCGTAATTTTCCTATTTCAGCCTGTCGCAGTGCGCAATTGCGTAGGGTTCGAAGTCCTTTTCCTCACTACCCACAGCTGCTCATCCTTAACCGGAAAGCATCAGACGGTGTATCTCCGCCGCCCTGCCGCAACCACTCCAATCAAGTTCTCTCTATAATTCAACATTTAATCAATTTAGAGATTGGATTAATTTTTTATCCCTATTTCCTGAAAATATTCCCCAAATCAATTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014141
ATGGGGGGAGATGATCGGACATTTAGGGCAAATTTCTCAAGTGAAGGAGTTTCGAGGCTTCGTGGGGTTGTCGAGGAGAAGCTCAAGGAGTTCATGGGTGACTACACCGATGACACTCTTGTGGAATATGTGATAGTCTTGCTAAAAAATGGTAGGAGTAGGGATGAAGCAAAAAATGAGCTGGATGTCTTTTTAGGAGATGACAGCGACTCTTTCATATCTTGGCTATGGGATCATCTGGGATCTAATCTAAGTTTATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798002.1
MGGDDRTFRANFSSEGVSRLRGVVEEKLKEFMGDYTDDTLVEYVIVLLKNGRSRDEAKNELDVFLGDDSDSFISWLWDHLGSNLSLYVQAQELEPVGVPKAEPAVGDQPRKTGSHQIESEADKQNSVETYGHHKNRENKGLVRGGNDEVSLPLKSVANNVNSRDENKPSDSQSKPLRFPQSTIHKKRRRNDEGQQQRKRDVSQSTVSAPKRLLQFAVRDAVATSRPSNATAEPSFKRLRSVVSTTDSYAEARPQRIHRAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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