当前解析结果
SmilChr03G002140| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002140 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002140 |
| 描述 | ADP,ATP carrier protein, mitochondrial-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 33337814 - 33343397 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131014142 |
|---|---|
| GeneID | 131014142 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014142 |
| 原始查询 | LOC131014142 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ADP,ATP carrier protein, mitochondrial-like |
| 产物 | ADP%2CATP carrier protein%2C mitochondrial-like |
| Arabidopsis | AT5G13490 (AAC2)ADP/ATP carrier 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831193] identity=80.2; qcov=0.946; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os05g0302700- identity=81.8; qcov=0.932; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0005471 (ATP:ADP antiporter activity); GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0140021 (mitochondrial ADP transmembrane transport); GO:1990544 (mitochondrial ATP transmembrane transport) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00153 (Mito_carr) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014142 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057798003.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057798003.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 1.00000 | XP_057798003.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057798003.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057798003.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:33340042 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B114,B25,B88 |
Chr3:33340099 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C1 |
Chr3:33340132 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B69,B75,C38,C71 |
Chr3:33340156 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B91,B95,B98,C50 |
Chr3:33340228 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B114,B25,B88 |
Chr3:33342075 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B98 |
Chr3:33343031 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr3:33343112 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A2,B123,B46 |
Chr3:33343148 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr3:33343169 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B118 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057798003.1PF00153
Mito_carr 36-131 aa
PF00153
Mito_carr 139-232 aa
PF00153
Mito_carr 239-328 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057798003.1 |
Pfam | PF00153 |
Mito_carr | Repeat | 36 | 131 | 2.1e-66 | 220.4 | Mitochondrial carrier protein |
XP_057798003.1 |
Pfam | PF00153 |
Mito_carr | Repeat | 139 | 232 | 2.1e-66 | 220.4 | Mitochondrial carrier protein |
XP_057798003.1 |
Pfam | PF00153 |
Mito_carr | Repeat | 239 | 328 | 2.1e-66 | 220.4 | Mitochondrial carrier protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。