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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003246`

染色体: Chr03 坐标: 50342915-50347081 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003246`
名称	SmilChr03G003246
描述	signal recognition particle 9 kDa protein
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	50342915 - 50347081 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014148`
GeneID	`131014148`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014148`
原始查询	`LOC131014148`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	signal recognition particle 9 kDa protein
产物	signal recognition particle 9 kDa protein
Arabidopsis	`AT3G49100` (AT3G49100) Signal recognition particle, SRP9/SRP14 subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824071] identity=80.6; qcov=1; evalue=2.84e-62; confidence=high
Rice	`-` -
GO	GO:0005786 (signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting); GO:0006614 (SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane); GO:0008312 (7S RNA binding); GO:0045900 (negative regulation of translational elongation)
KEGG	smil03060 (Protein export - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05486 (SRP9-21)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014148

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798008.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057798007.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057798008.1`
4	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057798008.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798007.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:50346783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B106,C48,D7
`Chr3:50346804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr3:50346811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B15,B66,C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798007.1

113 aa

113

SRP9-21

PF05486 SRP9-21 5-66 aa

XP_057798008.1

103 aa

103

SRP9-21

PF05486 SRP9-21 5-66 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798007.1`	Pfam	`PF05486`	SRP9-21	Domain	5	66	2.3e-14	54.1	Signal recognition particle 9 kDa protein (SRP9)
`XP_057798008.1`	Pfam	`PF05486`	SRP9-21	Domain	5	66	1.8e-14	54.4	Signal recognition particle 9 kDa protein (SRP9)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942025.1
CGCGACACCTTTATTCTATTTTCTAAACCCCCCTTTTAGATTTTACCAGAGTGAATTAAGCCATCGACCAAGTAGAAAACGACGTCGTGGTTTGGAAGAGCTCTGCGGTAAAAATTTGAGGGACGCCCAAAAACGTCGCATAATTCTCCCGGCGATCGATCCATTCGACCGCGTCTGGGTTTCTGCTCTTACATATATATTATCTGAAACCCTAGACTCAAGAGGAAAGCTGAATTTTCATTTTTGTGATCATGGTTTAC...

XM_057942024.1
ATTTTACCAGAGTGAATTAAGCCATCGACCAAGTAGAAAACGACGTCGTGGTTTGGAAGAGCTCTGCGGTAAAAATTTGAGGGACGCCCAAAAACGTCGCATAATTCTCCCGGCGATCGATCCATTCGACCGCGTCTGGGTTTCTGCTCTTACATATATATTATCTGAAACCCTAGACTCAAGAGGAAAGCTGAATTTTCATTTTTGTGATCATGGTTTACATTGAATCTTGGGATGATTTCGTCGAGAAGTCCGTCCAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014148
ATGGTTTACATTGAATCTTGGGATGATTTCGTCGAGAAGTCCGTCCAATTGTTTCGATCTGATCCCGAAAAGACTCGTTATGCCATGAAATACAGGCACTGTGATGGCAAATTGGTTCTCAAAGTCACCGATGATAGAGAGTGTATCAAATTTAAGACAGACCAAGCACAGGATGCAAAGAAGATGGAGAAGTTCAATAACATCTTCTTTACTTTGATGGCTCGGGGACCTGATGCCGACATATCTGAAGGTGGTGGAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798007.1
MVYIESWDDFVEKSVQLFRSDPEKTRYAMKYRHCDGKLVLKVTDDRECIKFKTDQAQDAKKMEKFNNIFFTLMARGPDGIVLTHYFSSVYAFHFHLNVRKQTRGVHCYLAAFI

XP_057798008.1
MVYIESWDDFVEKSVQLFRSDPEKTRYAMKYRHCDGKLVLKVTDDRECIKFKTDQAQDAKKMEKFNNIFFTLMARGPDADISEGGGKEQVEAQPARRGRGRKQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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