当前解析结果
SmilChr03G003255| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003255 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003255 |
| 描述 | fructokinase-1 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 50441858 - 50446449 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131014157 |
|---|---|
| GeneID | 131014157 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014157 |
| 原始查询 | LOC131014157 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | fructokinase-1 |
| 产物 | fructokinase-1 |
| Arabidopsis | AT1G06730 (AT1G06730)pfkB-like carbohydrate kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837184] identity=60.6; qcov=0.983; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os03g0164700- identity=63.8; qcov=0.829; evalue=0; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00294 (PfkB) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014157 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057798025.1 |
| 2 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 1.00000 | XP_057798025.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057798025.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057798025.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057798025.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:50442194 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B55,B78,C23 |
Chr3:50442293 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A18,B3,B8,C77,C87 |
Chr3:50442317 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A18,B3,B8,C77,C87 |
Chr3:50443553 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,B90,B92 |
Chr3:50443663 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr3:50443671 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C28 |
Chr3:50443793 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B102 |
Chr3:50444036 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B120,B139,B4,C55,D5 |
Chr3:50445854 |
AAC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B82 |
Chr3:50445854 |
AAC |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B82 |
Chr3:50445878 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,C51 |
Chr3:50445883 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C7 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057798025.1PF00294
PfkB 114-396 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057798025.1 |
Pfam | PF00294 |
PfkB | Domain | 114 | 396 | 3.5e-32 | 112.7 | pfkB family carbohydrate kinase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。