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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003274`

染色体: Chr03 坐标: 50694656-50696667 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003274`
名称	SmilChr03G003274
描述	uncharacterized SmilChr03G003274
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	50694656 - 50696667 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014180`
GeneID	`131014180`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014180`
原始查询	`LOC131014180`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0298600; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os12g0298600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G14385` (AT4G14385) histone acetyltransferase subunit NuA4-domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827083] identity=61.8; qcov=0.978; evalue=4.01e-43; confidence=medium
Rice	`Os12g0298600` - identity=61.3; qcov=1.02; evalue=6.19e-47; confidence=medium
GO	GO:0000123 (histone acetyltransferase complex); GO:0016573 (GO:0016573)
KEGG	smil03082 (ATP-dependent chromatin remodeling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF09340 (NuA4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014180

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798057.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057798057.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057798057.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798057.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798057.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:50695230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,D8
`Chr3:50695788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B66,C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798057.1

139 aa

139

NuA4

PF09340 NuA4 16-92 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798057.1`	Pfam	`PF09340`	NuA4	Family	16	92	2.1e-26	92.3	Histone acetyltransferase subunit NuA4

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942074.1
GAAATGTGCCAATTTCCTCCACAATTCTTGATCGCAGAGCGCGCTGGAAAACAAGGAAGCGCCGAAGAGAGCAAAGCAATAGTCGAATTCATCGCAGTCTTTGAACCCTAAATCTTGGATCTTCAACATGGATTCAGAAGGGCAACGAACATCTTCAAACCCTTCCGCAATGCTGGCTGCTCTATTGTGCAAAAGGGCTAAACTTCATGAAGAGCTCCGGAATATCGAAAAACAGGTATATGATATGGAGACGGGTTATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014180
ATGGATTCAGAAGGGCAACGAACATCTTCAAACCCTTCCGCAATGCTGGCTGCTCTATTGTGCAAAAGGGCTAAACTTCATGAAGAGCTCCGGAATATCGAAAAACAGGTATATGATATGGAGACGGGTTATTTACAGGATCCGAGCCAATGTGGCAATGTCTTGAAAGGTTTTGAAGGGTTTTTGTCTTCTTCCAAGAACACTACACTCTTGAAACGATCAAGGAAGTTTCAGCCTGACGACAGGCTGTTTTCATTGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798057.1
MDSEGQRTSSNPSAMLAALLCKRAKLHEELRNIEKQVYDMETGYLQDPSQCGNVLKGFEGFLSSSKNTTLLKRSRKFQPDDRLFSLSSVTSPAAEEIARDGGVTTNGPGKPKKGRGPREAKRRQSSEADFDYEDDPDLM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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