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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003331`

染色体: Chr03 坐标: 51586072-51589187 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003331`
名称	SmilChr03G003331
描述	TOM1-like protein 2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	51586072 - 51589187 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014225`
GeneID	`131014225`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014225`
原始查询	`LOC131014225`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TOM1-like protein 2
产物	TOM1-like protein 2
Arabidopsis	`AT1G06210` (AT1G06210) ENTH/VHS/GAT family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837130] identity=52.6; qcov=0.817; evalue=1.65e-103; confidence=high
Rice	`Os02g0697300` (tom1) - identity=41.3; qcov=0.841; evalue=1.08e-68; confidence=medium
GO	GO:0035091 (phosphatidylinositol binding); GO:0043130 (ubiquitin binding); GO:0043328 (protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway)
KEGG	-
Pfam	PF00790 (VHS); PF03127 (GAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014225

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057798097.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057798097.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057798097.1`
4	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.20000	`XP_057798097.1`
5	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057798097.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:51586430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr3:51586451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B128,B33,C85
`Chr3:51586549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B67,B97,C46
`Chr3:51586594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C38,C68
`Chr3:51586954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr3:51587017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C37
`Chr3:51587113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:51588771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,C11,C52,C63,C69
`Chr3:51588786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C38,C68
`Chr3:51588872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798097.1

377 aa

188

377

VHS

GAT

PF00790 VHS 45-173 aa PF03127 GAT 242-316 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798097.1`	Pfam	`PF00790`	VHS	Repeat	45	173	1.1e-20	74.7	VHS domain
`XP_057798097.1`	Pfam	`PF03127`	GAT	Domain	242	316	5.2e-16	59.3	GAT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942114.1
GAGTAGTAGTATTCGTATTTCCTAGTGTGGACTGGTGCAACTAACTCCAATTTTGAGCATATAATATTACTAGTATTAGTATCCTCTGCTTATCCTCCGTATCTCACTTTATCAATTCAACGCCGCCGCCCTCCCCCGCCATACCACAAATATCTCTTCCCAATCGCATCCATGGAGAAACTCGATTTAAACAAACTCAAGCTGGCCTCCTCCTCCCTCGGCGAGCGCATAAAGACCAGCGGCGCGCAGATGGGCCGCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014225
ATGGAGAAACTCGATTTAAACAAACTCAAGCTGGCCTCCTCCTCCCTCGGCGAGCGCATAAAGACCAGCGGCGCGCAGATGGGCCGCACCATCAGCTCCAAGATGAAGGAAATCCTCCAGTCCCCTACGCCGGAGTCCAAGGCCGTCGACGAGGCCACCGCCGAGACGCTGCCGGAGCCCAATTGGGGCCTCAACCTCCGCATTTGCGCCATGATCAGCCGCACCGAGTACGACGGCGCCGAGATCGTCAGGGCCATCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798097.1
MEKLDLNKLKLASSSLGERIKTSGAQMGRTISSKMKEILQSPTPESKAVDEATAETLPEPNWGLNLRICAMISRTEYDGAEIVRAIKKKLTAARSPPTQGLSLDLLEACTSNCEKVFSEVASEKVLDDMVRLIEDPRTDHGVRVRALQLIRGWGESNDLDYLPVFRQTYMNLKSREFPPTAPEESFPTVQRNLESYLGEQQLAPSEGHPIPNSGAANEEVPSFISYGFQSNEEKKEHLLVARNSLDILSSILNSDTEPKP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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