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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003345`

染色体: Chr03 坐标: 51778221-51781009 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003345`
名称	SmilChr03G003345
描述	uncharacterized protein At1g03900
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	51778221 - 51781009 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014239`
GeneID	`131014239`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014239`
原始查询	`LOC131014239`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsABCI16; symbol=OsABCI16; hit=Os10g0476000; species=rice; confidence=high
产物	OsABCI16; symbol=OsABCI16; hit=Os10g0476000; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G03900` (ABCI18) non-intrinsic ABC protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839378] identity=69; qcov=0.982; evalue=2.38e-114; confidence=high
Rice	`Os10g0476000` (OsABCI16) - identity=74; qcov=0.996; evalue=1.66e-133; confidence=high
GO	GO:0006897 (endocytosis); GO:0016020 (membrane); GO:0030125 (clathrin vesicle coat)
KEGG	-
Pfam	PF07933 (DUF1681)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014239

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798124.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057798124.1`
3	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.60000	`XP_057798124.1`
4	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.60000	`XP_057798124.1`
5	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057798124.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:51778517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B97,C47,C57
`Chr3:51778530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B42,B97,C57
`Chr3:51778539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B42,B97,C57
`Chr3:51778541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B42,B97,C57
`Chr3:51778549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B42,B97,C57
`Chr3:51778608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B110,B137,B22,B26,B28,C25,C33,C51,C56,D11
`Chr3:51778624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B22,B28
`Chr3:51778624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B28
`Chr3:51778659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr3:51778707`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B114,B88,C36
`Chr3:51778707`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B114,B88,C36
`Chr3:51778718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B88

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798124.1

282 aa

141

282

DUF1681

PF07933 DUF1681 10-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798124.1`	Pfam	`PF07933`	DUF1681	Domain	10	178	3.1e-57	193.4	Protein of unknown function (DUF1681)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942141.1
GAAATTAAAAGTCCGCTCCAAAAAAAGAAAAGAAATTAACCCGTGTGTCGCAAATGGCAACACACACACACACGATTATATTTTGGGCCGAAACGGCGGAGCCGATGTGCAGCAATAGCATCTCCAATTTAATACAGTTGACATCTCTATTTCAGTGTTGGGCAGCGCACGCTTTAAACTCACGTCTCCACCTCCACTTCACCTTCAACAACACAAATCCTGCATCTCAAAGCAACCAACCCCAATTCTGACACCACCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014239
ATGTCGCACGAAGACGACCAGGAGACCTTCGAGCACACCCTCCTCGTCGTCCGCGAAGTCGCCGTCTACAAGATCCCTCCCCGCCCCACCAGCGGCGGCTACAAGTGCGGCGAGTGGCTCCAGTCCGACAAGATCTGGTCCGGCCGCCTCCGCGTCGTCTCCTGTCACACCCGCTGCGAGATCCGCCTCGAGGACCCCAATTCCGGCGACCTCTTCGCCGCCTGCTTCGTCAATCCCGGCCAGCGGGACGCCGCCGTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798124.1
MSHEDDQETFEHTLLVVREVAVYKIPPRPTSGGYKCGEWLQSDKIWSGRLRVVSCHTRCEIRLEDPNSGDLFAACFVNPGQRDAAVEPVLDSSRYFVLRIEDGCGKHAFIGLGFSERNEAFDFNVALSDHEKYVKRDGEKEAGAGTGGAEVGDEGQIDIHPAVNHRLKEGETIRINVKNKPSSGAGMLSTAGLSSAVAKPKALGLAPPPAGAVKIRSPLPPPPNDPVAARLSGGHGSALNVAQENSRRSSDALSDLSQLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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