当前解析结果
SmilChr01G002263| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002263 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002263 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002263 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 39435058 - 39436642 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131014254 |
|---|---|
| GeneID | 131014254 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014254 |
| 原始查询 | LOC131014254 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os02g0328500- identity=27.8; qcov=0.492; evalue=1.06e-16; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014254 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057798151.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057798151.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057798151.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057798151.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057798151.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:39435189 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 89 | A10,A16,A2,A22,A24,A25,A5,A6,B105,B107,B108,B11,B111,B118,B123,B124,B125,B126,B130,B131,B136,B138,B14,B17,B21,B24,B25,B26,B3,B33,B34,B39,B4,B44,B46,B50,B52,B56,B59,B60,B61,B62,B65,B67,B68,B69,B70,B72,B80,B90,B97,B98,C12,C14,C17,C18,C19,C23,C24,C30,C32,C36,C37,C38,C4,C45,C46,C49,C53,C56,C57,C59,C62,C63,C66,C68,C70,C72,C73,C74,C77,C8,C83,C85,C87,D2,D3,D4,D9 |
Chr1:39435490 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B64,C9 |
Chr1:39435514 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B105,B22,C64,C85 |
Chr1:39435539 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B118,D6 |
Chr1:39435539 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B118,D6 |
Chr1:39435568 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B2 |
Chr1:39435587 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A20,B76 |
Chr1:39435626 |
C |
CG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 20 | A8,B10,B108,B110,B115,B12,B13,B64,B67,B71,B82,B90,B92,C23,C46,C47,C52,C74,C81,C86 |
Chr1:39435628 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A22,B76,C49 |
Chr1:39435634 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B44,C75,D3 |
Chr1:39435662 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B107,B5,B62,B76,C60 |
Chr1:39435664 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A24,B54,C41,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。