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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003361`

染色体: Chr03 坐标: 51951210-51952285 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003361`
名称	SmilChr03G003361
描述	patellin-1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	51951210 - 51952285 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014257`
GeneID	`131014257`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014257`
原始查询	`LOC131014257`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	patellin-1-like
产物	patellin-1-like
Arabidopsis	`AT1G72160` (AT1G72160) Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843547] identity=48.6; qcov=0.567; evalue=5.92e-45; confidence=medium
Rice	`Os01g0874700` (P0698A10.10-2) - identity=64.4; qcov=0.324; evalue=1.23e-36; confidence=low
GO	GO:0008289 (lipid binding)
KEGG	-
Pfam	PF03765 (CRAL_TRIO_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014257

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057798152.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057798152.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798152.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798152.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798152.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:51951313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr3:51951314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,B85
`Chr3:51951332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B7
`Chr3:51951348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B139,B32,C4
`Chr3:51951358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr3:51951380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C5
`Chr3:51951407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:51951438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr3:51951450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C44,C55
`Chr3:51951456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B130,C1,C17
`Chr3:51951486`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B111,C22
`Chr3:51951486`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B111,C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798152.1

312 aa

156

312

CRAL_TRIO_N

PF03765 CRAL_TRIO_N 178-226 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798152.1`	Pfam	`PF03765`	CRAL_TRIO_N	Domain	178	226	3.8e-10	40.5	CRAL/TRIO, N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942169.1
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCATTGTCACTCTTTTTGCTGCGCATTGCAATAGCAAAACATTTTCTATAGTTTGCTTTCATTTCAACGTCCAAGAAAATCTTCCATTTGTTTTTGTGTCATGGCTGAGGAAACAAAGAAGACAGCTGCCGAAGAGGCCGTGGTGTGCGACGTGCCGGTGGCGGAGGAAACAAAAACGACAGCTGCCGAAGCAGCCGAAGAGGTCGTGGTTTGCGACGTGTCGGTGGCGGAGGAGCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014257
ATGGCTGAGGAAACAAAGAAGACAGCTGCCGAAGAGGCCGTGGTGTGCGACGTGCCGGTGGCGGAGGAAACAAAAACGACAGCTGCCGAAGCAGCCGAAGAGGTCGTGGTTTGCGACGTGTCGGTGGCGGAGGAGCCCGTCGTGGAGAAGGAGAAAGAATGCGAGGAGGAAAGCAAGGTTGCGGAATCCGTTTCGTTCAAGGAGGAGAGCAACAAAGTTGATGACCTCATCGATCCGCAGAAGAAAGCTTTGGATGAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798152.1
MAEETKKTAAEEAVVCDVPVAEETKTTAAEAAEEVVVCDVSVAEEPVVEKEKECEEESKVAESVSFKEESNKVDDLIDPQKKALDEFKQLIQEALNKHDFTAPPPPSAAKEEVKKEEPKPQTEEEEKTEEPKPQAEEEKKEELEKTETCEEKETPTPCAEPSEAAEEIKETIVQEVKAEEAPPPAPEEVSIWGVPLLADERSDAILLKFLRARDFKVKEALAMLKNVVAWRKEFKIEELLAEEGLGEGLEKVVYVNGADK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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