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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003365`

染色体: Chr03 坐标: 51992037-51997779 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003365`
名称	SmilChr03G003365
描述	succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	51992037 - 51997779 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014261`
GeneID	`131014261`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014261`
原始查询	`LOC131014261`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial
产物	succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT2G20420` (AT2G20420) ATP citrate lyase (ACL) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816561] identity=85; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0621700` - identity=87.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004775 (succinate-CoA ligase (ADP-forming) activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006099 (tricarboxylic acid cycle); GO:0006104 (succinyl-CoA metabolic process); GO:0042709 (succinate-CoA ligase complex); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	smil00020 (Citrate cycle (TCA cycle) - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00640 (Propanoate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00549 (Ligase_CoA); PF08442 (ATP-grasp_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014261

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057798156.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057798156.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798156.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798156.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798156.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:51992371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B129,B50,C33
`Chr3:51992404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr3:51992563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C75
`Chr3:51994751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:51995080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C50
`Chr3:51995089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C58
`Chr3:51997423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B2,B24,B65,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798156.1

422 aa

211

422

ATP-grasp_2

Ligase_CoA

PF08442 ATP-grasp_2 29-237 aa PF00549 Ligase_CoA 297-417 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798156.1`	Pfam	`PF08442`	ATP-grasp_2	Domain	29	237	4.2e-57	193.7	ATP-grasp domain
`XP_057798156.1`	Pfam	`PF00549`	Ligase_CoA	Domain	297	417	2.6e-37	128.6	CoA-ligase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942173.1
GAAAGGCTAAATGCATGAATACTCTGACATAATTGTTCTAAAAAAAAAACCCTCTGCCATAATTGAATAATAAAAAAAGTAGTATTAAAGGATAAAAAGGTCAAAAGTCCACATAACGAAAAAATCAGCGTATTTGTGTGAATTCACTTCTCTCCGGCGAAGTTCGATCTTTCGCGAATCGATCTGAACAGAAGGGGTAAACACCACAGAAAGAGATGGTGAGAGGATTGCTCGGGAAACTAGCTAACCGCTCTCTCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014261
ATGGTGAGAGGATTGCTCGGGAAACTAGCTAACCGCTCTCTCTCCGTCGCCGGAAAATGGCAGCAGCAACAGCTACGCCGCCTCAACATACACGAGTATCAGGGAGCTGAGCTGATGGGCAAGCATGGTATCAATGTCCCAAAAGGTGTGGCTGTTGGATCAGTTGATGAAGTCAGGAAGGCACTGCGGGAAGTATTTCCCAACCAAAGTGAGGTGGTTGTGAAGTCTCAAATCCTTGCTGGTGGCCGAGGACTTGGAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798156.1
MVRGLLGKLANRSLSVAGKWQQQQLRRLNIHEYQGAELMGKHGINVPKGVAVGSVDEVRKALREVFPNQSEVVVKSQILAGGRGLGTFKNGFQGGVHIVKADKAEDVAGKMLGQMLVTKQSGPEGKIVSKVYLAEKLSLVNEMYFAITLDRITAGPLIISCKKGGTSIEDLAEKHPELIVKVPINVFTGITDEDAAKVVDGLSPKVADRNASIEQVKKLYELFCKCDCTLLEINPIAETADNQLVAADAKLNFDDNAAFR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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