当前解析结果
SmilChr03G003367| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003367 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003367 |
| 描述 | mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40 homolog |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 52027584 - 52030085 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131014263 |
|---|---|
| GeneID | 131014263 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014263 |
| 原始查询 | LOC131014263 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40 homolog |
| 产物 | mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40 homolog |
| Arabidopsis | AT5G23395 (MIA40)Cox19-like CHCH family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832404] identity=62.1; qcov=0.886; evalue=5.12e-50; confidence=medium |
| Rice | Os04g0527700 (MIA40)- identity=53.6; qcov=1.01; evalue=9.96e-39; confidence=medium |
| GO | GO:0005758 (mitochondrial intermembrane space); GO:0015035 (protein-disulfide reductase activity); GO:0022417 (GO:0022417); GO:0045041 (protein import into mitochondrial intermembrane space) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014263 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057798158.1 |
| 2 | Mitochondrion intermembrane space | Mitochondrion intermembrane space | 1.00000 | XP_057798158.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057798158.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057798158.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057798158.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:52027899 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B125,C32,C68,C73 |
Chr3:52027923 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C44 |
Chr3:52028014 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr3:52028052 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C48 |
Chr3:52028244 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B44 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。