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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003382`

染色体: Chr03 坐标: 52175671-52185917 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003382`
名称	SmilChr03G003382
描述	telomerase reverse transcriptase
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	52175671 - 52185917 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014273`
GeneID	`131014273`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014273`
原始查询	`LOC131014273`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	telomerase reverse transcriptase
产物	telomerase reverse transcriptase
Arabidopsis	`AT5G16850` (TERT) telomerase reverse transcriptase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831548] identity=36.8; qcov=1.03; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os12g0293100` (OsTERT) - identity=37.7; qcov=0.759; evalue=3.62e-160; confidence=medium
GO	GO:0000333 (telomerase catalytic core complex); GO:0003721 (GO:0003721); GO:0007004 (telomere maintenance via telomerase); GO:0042162 (telomeric repeat DNA binding); GO:0070034 (telomerase RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF12009 (Telomerase_RBD); PF21399 (TERT_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014273

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798176.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057798176.1`
3	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057798176.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057798176.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798176.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:52178469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C85
`Chr3:52178535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C85
`Chr3:52178549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B31,B57,C52,C75
`Chr3:52178550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B26,B38,B39,C86
`Chr3:52178855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C85
`Chr3:52178910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,C53
`Chr3:52178949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C85
`Chr3:52179220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr3:52179421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr3:52179459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C58,C85
`Chr3:52180255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:52180432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798176.1

1172 aa

586

1172

Telomerase_RBD

TERT_C

PF12009 Telomerase_RBD 463-587 aa PF21399 TERT_C 1012-1136 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798176.1`	Pfam	`PF12009`	Telomerase_RBD	Domain	463	587	3.2e-33	115.4	Telomerase ribonucleoprotein complex - RNA binding domain
`XP_057798176.1`	Pfam	`PF21399`	TERT_C	Domain	1012	1136	4.6e-15	56.8	Telomerase reverse transcriptase, C-terminal extension

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

17 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098125.1
TAAAAATTTCTGAAAATCAAATTTGAAACTGAAGAAATTGCGCCCTCTCATCTCTCGGCTCTCTCTGAACCCACCGGAGTCTGGACGCTGCAGCAAACCGACCCAGACGCCCATTCCCTTCGGCCTTTGCTCGCCTCCGAGTCCGAGCTCCGGCGGCGGCGCTCCAGCAGTCTCGGCGCACCCAGCAGTTCGGCCTTTGAAAGCAATTATTTGAATTGGTGAATTCCAACGGTACCCTTCCCTCCCTCTTCTCTTTTATG...

XR_009098123.1
AAAAATTTCTGAAAATCAAATTTGAAACTGAAGAAATTGCGCCCTCTCATCTCTCGGCTCTCTCTGAACCCACCGGAGTCTGGACGCTGCAGCAAACCGACCCAGACGCCCATTCCCTTCGGCCTTTGCTCGCCTCCGAGTCCGAGCTCCGGCGGCGGCGCTCCAGCAGTCTCGGCGCACCCAGCAGTTCGGCCTTTGAAAGTTGTCCCTTTTCCTCAAGCAATTATTTGAATTGGTGAATTCCAACGGTACCCTTCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014273
ATGCAACTCGAAATTTCTGTGAATACACCCTCGGCATTGATGGCGGCGAAGAAGAGAAAGAGAGTTCCGGAGGTTCTTTGGAGGCTGTTTGAAAATCAGGCGCGAACTCTTGCTGACACCATCGCGGCCTTGATCCCTCCTCCGTCGGACACAGCCACCGACAAAGCCATGTCGTTCCTCGTCAGATCGGGAGATCCGTTGGACTACCGCAAGCTCCTATCCGAATGTTTTGTGGTTGTCTCCGAAGATGCCCCTTCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798176.1
MQLEISVNTPSALMAAKKRKRVPEVLWRLFENQARTLADTIAALIPPPSDTATDKAMSFLVRSGDPLDYRKLLSECFVVVSEDAPSIPVFDPHRRWSQCEIVRRSIEIILHEQPSSSNLICCNYDKESRSSPVVDELSSSKWTLLLTRVGDAVMMYLLKYTSMFCPLPHKKHHQISGCPIDSLCSKFSKDMPKSRVYPCAYAGYKAKRQRVEGDRKQICPCTLDPEPSSNSISFATSNGSTYVFEEVPHIQSKVNSRKRT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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