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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000151`

染色体: Chr01 坐标: 2583977-2585591 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000151`
名称	SmilChr01G000151
描述	protein HIGH CHLOROPHYLL FLUORESCENCE PHENOTYPE 244, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	2583977 - 2585591 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014277`
GeneID	`131014277`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014277`
原始查询	`LOC131014277`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein HIGH CHLOROPHYLL FLUORESCENCE PHENOTYPE 244, chloroplastic-like
产物	protein HIGH CHLOROPHYLL FLUORESCENCE PHENOTYPE 244%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G35250` (HCF244) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829678] identity=89.8; qcov=0.823; evalue=3.66e-117; confidence=high
Rice	`Os08g0553800` (OJ1125_C01.13-1) - identity=86.7; qcov=0.805; evalue=3.88e-114; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05368 (NmrA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014277

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057798533.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057798533.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798533.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798533.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798533.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:2584006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B75,C33
`Chr1:2584009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr1:2584012`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A8
`Chr1:2584012`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A8
`Chr1:2584013`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	B38,B39,B60,B67,B69,B91,C15,C3,C30,C37,C64,C66,D10
`Chr1:2584016`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B132,B26
`Chr1:2584016`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B132,B26
`Chr1:2584020`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B19,B53,B96,C19
`Chr1:2584020`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B19,B53,B96,C19
`Chr1:2584063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B34,B77
`Chr1:2584064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,D7
`Chr1:2584067`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B78,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798533.1

215 aa

108

215

NmrA

PF05368 NmrA 40-211 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798533.1`	Pfam	`PF05368`	NmrA	Family	40	211	3.3e-08	34.2	NmrA-like family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942550.1
ATGGTCTTTAGTCGGGCTGATGGAGATGTCAAGACTGGAAGAAAAATAACAATAGATTCCAAACTTTGCAAATACTCAAAGCATCTCGTTTGGGGCAAAATCCGCCATCAAGTTGTTGGCGTACATACGGTTATTGACTGCGCTACAGGATGTCCGGAGGAGCCCATAAACACTGTTGATTGGGAAGGAAAAGTTGCTCTTATTCAATGTGGAAAGGCCATGGGCATCCAGAAATTTGTCTTCTTTTCCATCCACAACTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014277
ATGGTCTTTAGTCGGGCTGATGGAGATGTCAAGACTGGAAGAAAAATAACAATAGATTCCAAACTTTGCAAATACTCAAAGCATCTCGTTTGGGGCAAAATCCGCCATCAAGTTGTTGGCGTACATACGGTTATTGACTGCGCTACAGGATGTCCGGAGGAGCCCATAAACACTGTTGATTGGGAAGGAAAAGTTGCTCTTATTCAATGTGGAAAGGCCATGGGCATCCAGAAATTTGTCTTCTTTTCCATCCACAACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798533.1
MVFSRADGDVKTGRKITIDSKLCKYSKHLVWGKIRHQVVGVHTVIDCATGCPEEPINTVDWEGKVALIQCGKAMGIQKFVFFSIHNCDKHPEVPLMEIKYCTEKFLRDSGLNHIVIRLCGFMQGLIGQHAVPILEEKSVWGTDAPTRIAYMDTQDIARLTFIALRNESINRKLLTFAGPRAWTTQEVITLCERLAGQDANVTTVPVSVLRREDSP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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