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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003386`

染色体: Chr03 坐标: 52222220-52223805 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003386`
名称	SmilChr03G003386
描述	60S ribosomal protein L23
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	52222220 - 52223805 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014279`
GeneID	`131014279`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014279`
原始查询	`LOC131014279`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L23
产物	60S ribosomal protein L23
Arabidopsis	`AT2G33370` (AT2G33370) Ribosomal protein L14p/L23e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817900] identity=98.6; qcov=1; evalue=1.09e-98; confidence=high
Rice	`Os03g0139100` - identity=98.6; qcov=1; evalue=6.51e-99; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit); GO:0070180 (large ribosomal subunit rRNA binding)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00238 (Ribosomal_L14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014279

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798191.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057798191.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798191.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798191.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798191.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:52222448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B103,B127,B54
`Chr3:52222448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B127,B54
`Chr3:52222484`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A25,B71,B74,B76,B90
`Chr3:52222484`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A25,B71,B74,B76,B90
`Chr3:52222614`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A18,A4,B129,B48,B54,B58,B61,B92,B94,B97,C38,C40,C52,C7,C72
`Chr3:52223269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	181	A1,A10,A11,A13,A16,A18,A19,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A5,A7,A8,B1,B10,B101,B102,B104,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B130,B131,B132,B134,B135,B136,B138,B139,B15,B16,B2,B20,B21,B26,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B40,B42,B44,B46,B47,B48,B49,B5,B53,B54,B56,B57,B58,B59,B6,B61,B62,B66,B67,B68,B7,B70,B71,B72,B74,B76,B77,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C13,C14,C16,C19,C2,C21,C22,C26,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C36,C37,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C48,C49,C5,C51,C53,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C7,C70,C71,C73,C74,C75,C77,C79,C8,C80,C81,C83,C84,C85,C87,D1,D2,D3,D5,D6,D7
`Chr3:52223327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B78,C50,C84
`Chr3:52223335`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B11,B26,C1,C79
`Chr3:52223335`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B11,B26,C1,C79
`Chr3:52223414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr3:52223429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C55,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798191.1

140 aa

140

Ribosomal_L14

PF00238 Ribosomal_L14 21-140 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798191.1`	Pfam	`PF00238`	Ribosomal_L14	Domain	21	140	6.7e-42	142.9	Ribosomal protein L14p/L23e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942208.1
GAGTTCAATAGAATTGGGCCCAAAAACCTCTAAAGCCCATAAATCTGTCTGCTCAATTATACGAAGAAGAAACCCTAGCCCACATCCCAAGCGCTTGTAATTTCGCATACAAAACCCTAGCGCCTCCTCTCTCTTCATTTCCTTTTTGAGTTTCAGTAGAGAGAGAGTCCTGCGAAAATGTCGAAGCGAGGGCGCGGAGGAACGGCCGGTAACAAGTTCAGGATGTCACTGGGTCTGCCGGTGGCGGCGACGGTGAATTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014279
ATGTCGAAGCGAGGGCGCGGAGGAACGGCCGGTAACAAGTTCAGGATGTCACTGGGTCTGCCGGTGGCGGCGACGGTGAATTGCGCCGACAACACCGGCGCCAAGAACCTCTACATCATTTCGGTGAAGGGGATCAAGGGTCGCCTCAACAGGCTGCCCTCCGCCTGCGTCGGCGACATGGTTATGGCCACCGTGAAGAAGGGGAAGCCCGATCTCCGTAAGAAGGTCATGCCTGCCGTCATCGTCCGCCAGCGCAAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798191.1
MSKRGRGGTAGNKFRMSLGLPVAATVNCADNTGAKNLYIISVKGIKGRLNRLPSACVGDMVMATVKKGKPDLRKKVMPAVIVRQRKPWRRKDGVFMYFEDNAGVIVNPKGEMKGSAITGPIGKECADLWPRIASAANAIV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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