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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003392`

染色体: Chr03 坐标: 52340829-52342427 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003392`
名称	SmilChr03G003392
描述	probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA9
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	52340829 - 52342427 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014285`
GeneID	`131014285`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014285`
原始查询	`LOC131014285`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA9
产物	probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA9
Arabidopsis	`AT4G28720` (YUC8) Flavin-binding monooxygenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828993] identity=67.4; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0128900` (YUCCA7) - identity=67.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0009851 (auxin biosynthetic process); GO:0050660 (flavin adenine dinucleotide binding)
KEGG	smil00380 (Tryptophan metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00743 (FMO-like); PF07992 (Pyr_redox_2); PF13434 (Lys_Orn_oxgnase); PF13450 (NAD_binding_8); PF13738 (Pyr_redox_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014285

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057798200.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057798200.1`
3	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.40000	`XP_057798200.1`
4	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057798200.1`
5	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057798200.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:52341034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr3:52341037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C85
`Chr3:52341287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:52341842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr3:52342072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798200.1

409 aa

204

409

Pyr_redox_3

Pyr_redox_2

NAD_binding_8

FMO-like

Lys_Orn_oxgnase

PF13738 Pyr_redox_3 21-212 aa PF07992 Pyr_redox_2 21-218 aa PF13450 NAD_binding_8 22-62 aa PF00743 FMO-like 22-333 aa PF13434 Lys_Orn_oxgnase 85-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798200.1`	Pfam	`PF13738`	Pyr_redox_3	Family	21	212	2.5e-30	106.5	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
`XP_057798200.1`	Pfam	`PF07992`	Pyr_redox_2	Domain	21	218	6.5e-17	62.6	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
`XP_057798200.1`	Pfam	`PF13450`	NAD_binding_8	Domain	22	62	1.2e-05	26.2	NAD(P)-binding Rossmann-like domain
`XP_057798200.1`	Pfam	`PF00743`	FMO-like	Family	22	333	2.1e-26	93.2	Flavin-binding monooxygenase-like
`XP_057798200.1`	Pfam	`PF13434`	Lys_Orn_oxgnase	Family	85	203	4.3e-15	56.4	L-lysine 6-monooxygenase/L-ornithine 5-monooxygenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942217.1
CCCCCTCTCTCTCATCAAATTCCAAACCAACTCTCTTATTACAAACTCAACCTTCTCTCACTCTCTCAATTCGATCATCATCATCATCCAATCCAATCCAATCCATTCTTCAAGCTTGAAACTATATATACAAGATGTTTAATTTGACGGAGATGGACATGTTTTCGCGGCGGTGCGTATGGGTTAACGGCCCCGTGATAGTCGGGGCGGGGCCCTCTGGGCTGGCCGTGGCGGCCGGCCTCAGAGAGCAAGGCGTGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014285
ATGTTTAATTTGACGGAGATGGACATGTTTTCGCGGCGGTGCGTATGGGTTAACGGCCCCGTGATAGTCGGGGCGGGGCCCTCTGGGCTGGCCGTGGCGGCCGGCCTCAGAGAGCAAGGCGTGCCGTACGTAATTCTGGAGCGCGCCGACTGCATTGCATCCCTTTGGCAAAAGCGCACTTACGATAGGCTGAAGCTGCACCTCCCCAAGCAGTTCTGCCAACTGCCCAACTACCCCTTCCCCGATCACTACCCCGAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798200.1
MFNLTEMDMFSRRCVWVNGPVIVGAGPSGLAVAAGLREQGVPYVILERADCIASLWQKRTYDRLKLHLPKQFCQLPNYPFPDHYPEYPSKKQFVEYLESYTAHHDIRPHFNESVDSAKYDDACRLWRVKTAATEYICQWLVVATGENAEPVVPDVEGLASFGGEVVHACDYKSGEKFKGKKVLVVGCGNSGMEVSLDLCNHDARPAMVVRNAVHVLPREMLGKSTFELAMLMMKWLPLWLVDKLLLFLAWIILGNIENIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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