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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003401`

染色体: Chr03 坐标: 52382374-52388352 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003401`
名称	SmilChr03G003401
描述	uncharacterized SmilChr03G003401
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	52382374 - 52388352 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014291`
GeneID	`131014291`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014291`
原始查询	`LOC131014291`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	methyl-coenzyme M reductase II subunit gamma, putative (DUF3741) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828997]; symbol=TRM20; hit=AT4G28760; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	methyl-coenzyme M reductase II subunit gamma, putative (DUF3741) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828997]; symbol=TRM20; hit=AT4G28760; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G28760` (TRM20) methyl-coenzyme M reductase II subunit gamma, putative (DUF3741) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828997] identity=37; qcov=1.02; evalue=4.21e-123; confidence=medium
Rice	`Os03g0143700` - identity=32.1; qcov=1.09; evalue=5.49e-84; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12552 (DUF3741); PF14309 (DUF4378); PF14383 (VARLMGL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014291

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057798207.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057798207.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057798207.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798207.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798207.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:52384980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B120
`Chr3:52385001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,A21,A6,B66,C68
`Chr3:52385007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,A21,A6,B66,C68
`Chr3:52385066`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A10,B55,C6,C65,C70
`Chr3:52385066`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A10,B55,C6,C65,C70
`Chr3:52385212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:52385356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr3:52385589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B34,B61,B86
`Chr3:52385737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr3:52386000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr3:52386001`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B140,D11
`Chr3:52386001`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B140,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798207.1

849 aa

424

849

VARLMGL

DUF3741

DUF4378

PF14383 VARLMGL 6-23 aa PF12552 DUF3741 73-142 aa PF14309 DUF4378 667-840 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798207.1`	Pfam	`PF14383`	VARLMGL	Domain	6	23	5.7e-06	26.5	DUF761-associated sequence motif
`XP_057798207.1`	Pfam	`PF12552`	DUF3741	Domain	73	142	1.3e-24	87.0	Protein of unknown function (DUF3741)
`XP_057798207.1`	Pfam	`PF14309`	DUF4378	Domain	667	840	2.7e-20	74.1	LONGIFOLIA 1/2-like C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942224.1
AAGTCGAGTGCAAAGCGGTGGTACGAAAAAAACGAATGCTCACTGCGAGCCAAAAGCAAAGCTACTCATATATCTATCTCTGTAGTGCCTCAAATTCCGGCGACATTCACGCCGGAACGTGGGATTCCGACGAGTGCTCCTCTTTAAACGTTGTCTCTTACTTCACCTACTCATATCCGCTGCTGTATAATACTGGTTTTCACTTGGAATAAATTTGAAGAGATTGTGCATTGTTTCGCTGCTCACATTGTTCGAATTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014291
ATGGAGTCAACACAAGGTCCACCTAATTTGGTTGCTAAATTAATGGGACTTGAAGCCCTTCCCCAGCAGGAACCTGACTCAGTTGTATTTAGAAATCATTATGGAGGTCATTCTCGAAATTGTTCGGATGTCCCCATGAGTTACTGGGAACAACAGGATGAATTCTTTCACTTCCTCGATCCAAGTGGACATAAAGCTGCTTGTAAAATTCGGCAGCGGTCGCAGAAATCAACTCATGCGGCAAGATATAAGGAGACCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798207.1
MESTQGPPNLVAKLMGLEALPQQEPDSVVFRNHYGGHSRNCSDVPMSYWEQQDEFFHFLDPSGHKAACKIRQRSQKSTHAARYKETINDRKMGLVRQNFIEAKRLSVNERLRQSKQFQDALEVLSSNKDLFLKCLQEPHSMFPENLYSRQSDSNPPETKRITILRPSKRAENNEFVVTGNEDTKKIKKEAFLQLNGLEKVQSGSSSPESLKYYENPSRPTQIVVLKPTRKKASDDMAAASPFSEQPMMLRREDLFRYIED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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