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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003406`

染色体: Chr03 坐标: 52407989-52413100 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003406`
名称	SmilChr03G003406
描述	uncharacterized SmilChr03G003406
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	52407989 - 52413100 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014296`
GeneID	`131014296`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014296`
原始查询	`LOC131014296`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	HIT-type Zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829003]; symbol=AT4G28820; hit=AT4G28820; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	HIT-type Zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829003]; symbol=AT4G28820; hit=AT4G28820; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G28820` (AT4G28820) HIT-type Zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829003] identity=41.1; qcov=1.18; evalue=1.45e-31; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	GO:0000463 (maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0000492 (box C/D snoRNP assembly); GO:0005634 (nucleus); GO:0048254 (snoRNA localization); GO:0070761 (pre-snoRNP complex)
KEGG	-
Pfam	PF04438 (zf-HIT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014296

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798210.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798210.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798210.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798210.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798210.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:52409378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr3:52412319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,C72,D11
`Chr3:52412544`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A15,B71,B88,C62,C81,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798210.1

134 aa

134

zf-HIT

PF04438 zf-HIT 3-32 aa

XP_057798211.1

134 aa

134

zf-HIT

PF04438 zf-HIT 3-32 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798210.1`	Pfam	`PF04438`	zf-HIT	Domain	3	32	1.3e-10	41.6	HIT zinc finger
`XP_057798211.1`	Pfam	`PF04438`	zf-HIT	Domain	3	32	1.3e-10	41.6	HIT zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942228.1
TAAATTTCGGTTCTTACCTTAAGCTCTGTCAAACCCGCCGCCCCAGCACTTCCTCACGGACCTCACCTCACCCAACACTCAAATCCTAGCGCCGCACCGGACCGCCCAGCAGCAGCCTCCCCTCGCGCCACGCCGCCAGCAATCGCCTCCGTTTCACGCCGGCACCATCCCGCCTCCACGACCCCTGTCTCCATTCCAATAAGCTGAAGCTGCGTATGAAATTCAAAAATATGTGAAATGTGGGAATATACTGTTTCCAA...

XM_057942227.1
TAAATTTCGGTTCTTACCTTAAGCTCTGTCAAACCCGCCGCCCCAGCACTTCCTCACGGACCTCACCTCACCCAACACTCAAATCCTAGCGCCGCACCGGACCGCCCAGCAGCAGCCTCCCCTCGCGCCACGCCGCCAGCAATCGCCTCCGTTTCACGCCGGCACCATCCCGCCTCCACGACCCCTGTCTCCATTCCAATAAGCTGAAGCTGCGTATGAAATTCAAAAATATGTGAAATGTGGGAATATACTGTTTCCAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014296
ATGGGGCAAAAGAAATGTCAAGTGTGTGAGGACGCACAATCAAAGTATAAGTGCCCTACTTGCTTAATAACCTATTGTTCTTTGGCCTGCTTCAAGAAACACAAAGAAGTTCCTTGCCAGAAAGCAGAATCTTTAAAGGAAGAAAAAGTTTATCTTAGAACAACAAATGATAACCAACCACCTCATGTGGATGAGCCAAGTGAGGTGTTGCAAGAGTTGCAACTACAGTCTGTTGCTTCATCCAATGAAATTCGTGATTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798210.1
MGQKKCQVCEDAQSKYKCPTCLITYCSLACFKKHKEVPCQKAESLKEEKVYLRTTNDNQPPHVDEPSEVLQELQLQSVASSNEIRDLVKNEKLQTLIYNIDCSVDPENELDKAMEEESFRQFAEKILSTIVPDA

XP_057798211.1
MGQKKCQVCEDAQSKYKCPTCLITYCSLACFKKHKEVPCQKAESLKEEKVYLRTTNDNQPPHVDEPSEVLQELQLQSVASSNEIRDLVKNEKLQTLIYNIDCSVDPENELDKAMEEESFRQFAEKILSTIVPDA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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