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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003410`

染色体: Chr03 坐标: 52436007-52438820 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003410`
名称	SmilChr03G003410
描述	uncharacterized protein At4g13200, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	52436007 - 52438820 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014299`
GeneID	`131014299`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014299`
原始查询	`LOC131014299`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826935]; symbol=AT4G13200; hit=AT4G13200; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826935]; symbol=AT4G13200; hit=AT4G13200; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G13200` (AT4G13200) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826935] identity=67.4; qcov=0.475; evalue=6.92e-34; confidence=medium
Rice	`Os04g0513000` - identity=45.7; qcov=0.702; evalue=4.7e-27; confidence=medium
GO	GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0010027 (thylakoid membrane organization)
KEGG	-
Pfam	PF20711 (DUF6825)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014299

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057798214.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057798214.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057798214.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798214.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798214.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:52436203`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B6
`Chr3:52436203`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B6
`Chr3:52436341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B125,B138,B33,B78
`Chr3:52436353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B37,B9,C25,C6,D4
`Chr3:52437966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,D2,D5
`Chr3:52438529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,B9,C25,D4
`Chr3:52438597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr3:52438629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798214.1

181 aa

181

DUF6825

PF20711 DUF6825 63-160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798214.1`	Pfam	`PF20711`	DUF6825	Family	63	160	3.5e-34	118.1	Family of unknown function (DUF6825)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942231.1
GAAAGGTATGAAATAGAGAGACACGCGAGCACAATTGCCCAACTAACTTCACTTCACTTCACTTCACCTTCTAGTTCTACTAATATGCAGAGAGATAAAAGGGGGAGATAGAGAGATTTGAGGAGGGAGAGAAGAAAAAAGAGTAGGACGAAGAAGGGAAAGGGGAAATGATTGGGCGAGTGCATTCCGCACCCTCCTATTCGGTTCCTTCACCATCCATAATCCATCGCCCTCCTTGCTCTATTAAGCCACGTGACCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014299
ATGATTGGGCGAGTGCATTCCGCACCCTCCTATTCGGTTCCTTCACCATCCATAATCCATCGCCCTCCTTGCTCTATTAAGCCACGTGACCTCTCCTTATCCCCTTCCAACCTCAACCTTCTCTCCTCTAGATCTCCATCAACTACTTTCAGCTGCAACTGCACTCGCGATTCCGGTGAGAATGAGAGCAAAACAATCTTAGATGCATTTTTCTTGGGAAAGGCAGTCGCTGAGGCACTTAATGAGCGTCTAGAATCGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798214.1
MIGRVHSAPSYSVPSPSIIHRPPCSIKPRDLSLSPSNLNLLSSRSPSTTFSCNCTRDSGENESKTILDAFFLGKAVAEALNERLESAVGEFLSSIGRLQAEQQKQVQEFQDEVLEKARRAKEQAAMEAKGLVPPANSSADKVSAVNGVASNTYSPADSVNSTTSSLQSEPFDHENDPPNDG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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