当前解析结果
SmilChr03G003412| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003412 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003412 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003412 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 52458654 - 52459965 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131014302 |
|---|---|
| GeneID | 131014302 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014302 |
| 原始查询 | LOC131014302 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822073]; symbol=AT3G24750; hit=AT3G24750; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822073]; symbol=AT3G24750; hit=AT3G24750; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT3G24750 (AT3G24750)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822073] identity=46.8; qcov=0.815; evalue=2.96e-23; confidence=medium |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014302 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057798218.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057798217.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057798217.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057798217.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057798217.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:52458949 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 39 | A14,A18,A25,B105,B119,B122,B124,B128,B134,B138,B18,B28,B49,B63,B70,B75,B79,B80,B81,B83,B87,B93,B95,B99,C11,C19,C20,C27,C3,C37,C42,C47,C64,C66,C69,C70,C72,C78,C83 |
Chr3:52459161 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A25,C72 |
Chr3:52459424 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr3:52459434 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr3:52459435 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。