当前解析结果
SmilChr03G003420| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003420 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003420 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003420 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 52539660 - 52541892 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131014310 |
|---|---|
| GeneID | 131014310 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014310 |
| 原始查询 | LOC131014310 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | fringe-like protein (DUF604) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831121]; symbol=AT5G12460; hit=AT5G12460; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | fringe-like protein (DUF604) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831121]; symbol=AT5G12460; hit=AT5G12460; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G12460 (AT5G12460)fringe-like protein (DUF604) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831121] identity=44.2; qcov=0.986; evalue=2.02e-59; confidence=medium |
| Rice | Os08g0137300- identity=38.7; qcov=0.995; evalue=6.71e-38; confidence=medium |
| GO | GO:0008375 (acetylglucosaminyltransferase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF04646 (DUF604) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014310 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057798228.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057798228.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057798228.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057798228.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057798228.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:52541330 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C3 |
Chr3:52541643 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C38 |
Chr3:52541718 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B18,B25,B56,B85,C67 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057798228.1PF04646
DUF604 5-193 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057798228.1 |
Pfam | PF04646 |
DUF604 | Family | 5 | 193 | 8e-59 | 199.8 | Protein of unknown function, DUF604 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。