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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003424`

染色体: Chr03 坐标: 52560603-52571656 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003424`
名称	SmilChr03G003424
描述	actin-related protein 2/3 complex subunit 1B-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	52560603 - 52571656 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014313`
GeneID	`131014313`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014313`
原始查询	`LOC131014313`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	actin-related protein 2/3 complex subunit 1B-like
产物	actin-related protein 2/3 complex subunit 1B-like
Arabidopsis	`AT2G31300` (ARPC1B) actin-related protein C1B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817687] identity=73; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0817200` (OsWD40-59) - identity=71.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005885 (Arp2/3 protein complex); GO:0015629 (actin cytoskeleton); GO:0034314 (Arp2/3 complex-mediated actin nucleation); GO:0051015 (actin filament binding)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04517 (IgSF CAM signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04519 (Cadherin signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil05100 (Bacterial invasion of epithelial cells - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00400 (WD40); PF12894 (ANAPC4_WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014313

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057798230.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057798230.1`
3	Cytoskeleton	细胞骨架	0.40000	`XP_057798230.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057798230.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798230.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:52560924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,C58
`Chr3:52561973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr3:52563211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:52570181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B53,B77,B8
`Chr3:52570182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr3:52570191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798230.1

373 aa

186

373

WD40

ANAPC4_WD40

WD40

PF00400 WD40 45-82 aa PF12894 ANAPC4_WD40 104-173 aa PF00400 WD40 141-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798230.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	45	82	1.4e-19	70.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057798230.1`	Pfam	`PF12894`	ANAPC4_WD40	Repeat	104	173	3.6e-14	53.5	Anaphase-promoting complex subunit 4 WD40 domain
`XP_057798230.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	141	171	1.4e-19	70.3	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942247.1
TAGTATGTGAATATGCCCTTCACCTTCACCACCACGACGATTTCTGTTCATCAACCCAGCCAACTAACCGTAGCAACCACGCTAATCTAGCAAGATAGCTGCTGTTTAATCTCTTTCCATAAGATACATCGATGCCACCAAACAGATCTTAGTCTCAACCATCGCTTCAATTCCAATTTCGAAATTTGGTTGAAGAATTCTGTATCATTTCAACTTCATTCCCGAAAAGTTTAAGTTTGGTACAAGAATTGAATACAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014313
ATGGCTTCAGTCTCAGTTCATCAGTTCGCTCCGTGCATCACCTGTCATGCTTGGAGCCCAGATCATTCCATGATAGCTTTTTGTCCCAATAACAACGAAGTGCATATCTATAAGATGTTGGAAGGCAAGTGGGAGAAGATCCATGTTCTTCAAAAGCATGATCAACTTGTTTCAGGAATAGACTGGAGCAGACGCTCGGACCAGATAGTCACTGTTTCTCATGATCGGAATTCGTATGTTTGGTCACAAGAAGCCACAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798230.1
MASVSVHQFAPCITCHAWSPDHSMIAFCPNNNEVHIYKMLEGKWEKIHVLQKHDQLVSGIDWSRRSDQIVTVSHDRNSYVWSQEATEWVPTLVILRLNRAALCVQWSPKENKFAVGSGAKTVCICYYEQENNWWVSKIIRKRHDSSVTSIAWHPNNIFLATTSTDGKCRVFSTFIKGVDTKHSSSGSDSKFGEQIMQLDLSHTWTFGIRWSPSGNTLAYAGHDSMIYFVDEIGSSPSAQSVAFRDLPLRDVLFLSERMVI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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