当前解析结果
SmilChr03G003435| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003435 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003435 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003435 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 52704753 - 52705971 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131014324 |
|---|---|
| GeneID | 131014324 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014324 |
| 原始查询 | LOC131014324 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014324 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057798240.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057798240.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057798240.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057798240.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057798240.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:52704866 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B129,B88,C66 |
Chr3:52704875 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A3,B122,B123,C25 |
Chr3:52704877 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B123,C25 |
Chr3:52704880 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B110 |
Chr3:52704883 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr3:52704890 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C77 |
Chr3:52704896 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C58,C68,C77 |
Chr3:52704916 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 11 | B102,B28,B89,B92,C14,C21,C33,C42,C78,D1,D5 |
Chr3:52704917 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C27,C77,C86 |
Chr3:52704928 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A8,B20 |
Chr3:52704929 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B54 |
Chr3:52704931 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。