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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003452`

染色体: Chr03 坐标: 52875517-52885631 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003452`
名称	SmilChr03G003452
描述	uncharacterized SmilChr03G003452
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	52875517 - 52885631 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014339`
GeneID	`131014339`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014339`
原始查询	`LOC131014339`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832542]; symbol=AT5G24710; hit=AT5G24710; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832542]; symbol=AT5G24710; hit=AT5G24710; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G24710` (AT5G24710) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832542] identity=76.1; qcov=0.967; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0653800` - identity=71.9; qcov=0.971; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014339

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057798254.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057798254.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057798254.1`
4	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.60000	`XP_057798254.1`
5	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057798254.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:52875874`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr3:52876062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr3:52876306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B26,B38,B39,C86
`Chr3:52877509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:52877627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:52877899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B99,C14,C44
`Chr3:52878264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr3:52878419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C47
`Chr3:52878602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr3:52878760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr3:52879315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:52879317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B54,C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798254.1

1353 aa

676

1353

WD40

PF00400 WD40 209-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798254.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	209	243	1.2e-06	29.5	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942271.1
CTGAAGCCTGAACCGTAAAATTAAATTCGCCTGAAATACCAGGTTGTACCATTTTTTTCTAGCAACCCCCTAGCCTAGCTCATCGTCAGAGCAAAATTGAGTCGATCTGAACCGCTTCTTCTCTGGCGATCAGCAAACAATCTTTCCAACTTTTCTTCATTCGGATTCAGATCCGTGTTTTAGTAGAACCGAGAGAGAAATTTGAACGCAATGCTGCGGTTGCGGGCCTTCCGGCCGACGAGTGATAAGATTGTGAAGAT...

XM_057942273.1
GTTATTTACGAGTTGAAAGCTGGAGGTGTGGATGAGAGACGTTTAGTTGGTGCTAAATTGGAGAAGCTCGCGGAGGGCGAAACAGAGCCTAGAGGTAAACCTACAGAAGCCATACGAGGTGGAAGGTTAGCTTTTATGATGATGATGTACGCTATTGGCAACTTTGGCGGAATCGGTCTGCTGCTGCTGAAGCTCCAACGGCTGTCAACAATATCACCTCAACTTTAAGTTCCCCTGCTCCCTCAACGAAAGGACGCCAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014339
ATGCTGCGGTTGCGGGCCTTCCGGCCGACGAGTGATAAGATTGTGAAGATTCAATTGCATCCGACACATCCGTGGCTTGTAACTGCCGATGCGTCAGATCACGTCTCCGTTTGGAATTGGGAACACCGCCAGGTTATTTACGAGTTGAAAGCTGGAGGTGTGGATGAGAGACGTTTAGTTGGTGCTAAATTGGAGAAGCTCGCGGAGGGCGAAACAGAGCCTAGAGGTAAACCTACAGAAGCCATACGAGGTGGAAGTGT...

LOC131014339
ATGCGTGGCCGAGATGTACCAAAGCAGGACTTGGATAACAGATCTCTCCTATGCATGGAATTCTTGTGTAGATCTACTGCCAGTGATGGGCCCCTTGTTGCGTTTGGCGGATCAGATGGTGTGATCAGAGTTCTTTCTATGCTAACTTGGAAGCTTGCTAGAAGATATACAGGAGGTCATAAAGGATCAATTTCTTGTTTAATGACTTTCATGGCCTCTTCCGGCGAGGCCCTTTTGGTTTCTGGTGGCAGTGATGGCTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798254.1
MLRLRAFRPTSDKIVKIQLHPTHPWLVTADASDHVSVWNWEHRQVIYELKAGGVDERRLVGAKLEKLAEGETEPRGKPTEAIRGGSVKQVSFYDDDVRYWQLWRNRSAAAEAPTAVNNITSTLSSPAPSTKGRHFLVICCENKAIFLDLVTMRGRDVPKQDLDNRSLLCMEFLCRSTASDGPLVAFGGSDGVIRVLSMLTWKLARRYTGGHKGSISCLMTFMASSGEALLVSGGSDGLLVLWNADYGQDSRELVPKLSLK...

XP_057798256.1
MRGRDVPKQDLDNRSLLCMEFLCRSTASDGPLVAFGGSDGVIRVLSMLTWKLARRYTGGHKGSISCLMTFMASSGEALLVSGGSDGLLVLWNADYGQDSRELVPKLSLKAHDGGVVAIELSHVLGAAPQLITIGADKTLAIWDTITFKELRRIKPVSKLACHSVASWSHPRAPNLDILTCVKDSHIWAIEHPTYSALTRPLCELSSLVPPQLLASHKKLRVYSMVAHSLQPHLVATGTNMGVLVCEFDAKSLPPVAPLPT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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