当前解析结果
SmilChr03G003453| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003453 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003453 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003453 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 52896279 - 52899417 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131014340 |
|---|---|
| GeneID | 131014340 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014340 |
| 原始查询 | LOC131014340 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os02g0704600; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os02g0704600; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G66480 (AT5G66480)bacteriophage N4 adsorption B protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836780] identity=40; qcov=0.541; evalue=2.06e-35; confidence=medium |
| Rice | Os02g0704600- identity=39.7; qcov=0.524; evalue=1.11e-36; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014340 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Peroxisome | 过氧化物酶体 | 0.60000 | XP_057798257.1 |
| 2 | Mitochondrion outer membrane | 线粒体外膜 | 0.40000 | XP_057798257.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057798257.1 |
| 4 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.20000 | XP_057798257.1 |
| 5 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057798257.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:52896719 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B9,C22,C25,D4 |
Chr3:52896858 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B102 |
Chr3:52897803 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B113 |
Chr3:52897840 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr3:52897962 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A23,A9,B104,C5 |
Chr3:52897988 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,A9,B104,B136,C5 |
Chr3:52897989 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A3,B121,B49 |
Chr3:52897991 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,A9,B104,B136,C5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。