当前解析结果
SmilChr03G003465| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003465 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003465 |
| 描述 | hydrophobic protein RCI2A |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 53064268 - 53065565 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131014352 |
|---|---|
| GeneID | 131014352 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014352 |
| 原始查询 | LOC131014352 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hydrophobic protein RCI2A |
| 产物 | hydrophobic protein RCI2A |
| Arabidopsis | AT3G05880 (RCI2A)Low temperature and salt responsive protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819757] identity=87; qcov=1; evalue=1.17e-28; confidence=medium |
| Rice | Os05g0138300 (OsLti6b)- identity=83; qcov=0.981; evalue=2.46e-25; confidence=medium |
| GO | GO:0016020 (membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01679 (Pmp3) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014352 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.80000 | XP_057798280.1 |
| 2 | Secretory vesicle | Secretory vesicle | 0.20000 | XP_057798280.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057798280.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057798280.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057798280.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057798280.1PF01679
Pmp3 6-52 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057798280.1 |
Pfam | PF01679 |
Pmp3 | Family | 6 | 52 | 4.7e-22 | 78.4 | Proteolipid membrane potential modulator |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。