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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000418`

染色体: Chr01 坐标: 8436603-8437870 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000418`
名称	SmilChr01G000418
描述	uncharacterized SmilChr01G000418
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	8436603 - 8437870 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014355`
GeneID	`131014355`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014355`
原始查询	`LOC131014355`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=26.6; qcov=0.836; evalue=3.87e-31; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=29.1; qcov=1.06; evalue=3.2e-43; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014355

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798324.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057798324.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798324.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798324.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798324.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:8436605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:8436613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,C19
`Chr1:8436661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B138,B55
`Chr1:8436683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B107,B53,B88,D5
`Chr1:8436686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:8436719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B103,B66
`Chr1:8436723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C5
`Chr1:8436726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,D11
`Chr1:8436740`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B107,B88
`Chr1:8436740`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B107,B88
`Chr1:8436757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B61,C17,C63
`Chr1:8436757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,C17,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798324.1

378 aa

189

378

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF10551 MULE 6-99 aa PF00872 Transposase_mut 6-149 aa PF04434 SWIM 235-266 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798324.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	6	99	2.9e-21	76.3	MULE transposase domain
`XP_057798324.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	6	149	1e-13	51.7	Transposase, Mutator family
`XP_057798324.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	235	266	1.4e-07	31.6	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942341.1
ATGTGCCTAAGGCCAATAATTGTGGTAGATGGCACACACTTGAAGGGTCGTAACAAAGGGATCTTGTTTGTTGCAGTGACGAAGGATGGTAACGAACAAGTCTTTCCCATGGCATTCGGCGTTGGGCCTATAGAGAATAATGAATCTTGGACGTGGTTTTTGTCTCGATTGAAGTTGGCTTATGGTCAGAATTCTGAAACTTTGATTGTTTCAGATGCACATGTCAGCATAGAGAATGCTATAAATGTTGTATATCCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014355
ATGTGCCTAAGGCCAATAATTGTGGTAGATGGCACACACTTGAAGGGTCGTAACAAAGGGATCTTGTTTGTTGCAGTGACGAAGGATGGTAACGAACAAGTCTTTCCCATGGCATTCGGCGTTGGGCCTATAGAGAATAATGAATCTTGGACGTGGTTTTTGTCTCGATTGAAGTTGGCTTATGGTCAGAATTCTGAAACTTTGATTGTTTCAGATGCACATGTCAGCATAGAGAATGCTATAAATGTTGTATATCCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798324.1
MCLRPIIVVDGTHLKGRNKGILFVAVTKDGNEQVFPMAFGVGPIENNESWTWFLSRLKLAYGQNSETLIVSDAHVSIENAINVVYPDVAHGLCYYHLLNKLTRFGKAAVALYQKVAYAYRDSEFDAAMASLKALKEEGGAYSKLMQFFDIKNIDESFNSRLLWAKRLPICSMVEAIRHIIEKWFDERHEATKSFSGDVTQEALRKLSVELERSRRYEVISMSRTAFKVKSSNKTFKVNLQTQSCTCVEWDLNMLPCSHAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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